HASSAN, Ahmed Adel I. H., Pradeep HIRIYUR NAGARAJ, Adrien CHAUVIER, Nils WALTER a Gabriel DEMO. Translation initiation stages of coupled transcription-translation. In 16th Multinational congress on Microscopy. 2022. ISBN 978-80-11-02253-2.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Translation initiation stages of coupled transcription-translation
Název česky Fáze iniciace translace spojené transkripce-translace
Autoři HASSAN, Ahmed Adel I. H. (818 Egypt), Pradeep HIRIYUR NAGARAJ (356 Indie), Adrien CHAUVIER (250 Francie), Nils WALTER (840 Spojené státy) a Gabriel DEMO (703 Slovensko, garant, domácí).
Vydání 16th Multinational congress on Microscopy, 2022.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14740/22:00127445
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
ISBN 978-80-11-02253-2
Klíčová slova česky translace - iniciace - kryoEM - struktura
Klíčová slova anglicky translation - initiation - cryoEM - structure
Štítky rivok
Změnil Změnil: Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765. Změněno: 14. 12. 2022 15:59.
Anotace
Transcription and translation are functionally coupled and highly coordinated in most bacterial species, with few exceptions such as Bacillus subtilis. Translational riboswitches (cis-acting RNA structures) located in the 5-untranslated region of mRNAs can modulate transcription pausing or premature termination. They can regulate both transcription and translation in a ligand-dependent manner and serve as an excellent model system to investigate the coordination of coupled transcription-translation. Here we use a pre-queuosine1 (PreQ1) sensing riboswitch to understand the coordination of translation initiation and RNA polymerase (RNAP) pausing during transcription. Using cryo-electron microscopy as a primary approach we investigate the mRNA loading mechanism onto small ribosomal subunit (30S) and the coordination of translation initiation and transcription elongation. Our specific focus is to understand the dynamics of 30S binding to the mRNA riboswitch containing ribosomal binding site, formation and stabilization of pre-initiation complex and subsequent transient interactions during the initial steps of transcription-translation coupling.
Anotace česky
Transkripce a translace jsou u většiny bakterií funkčně spojeny a vysoce koordinované, s několika výjimkami, jako je Bacillus subtilis. Translační riboswitche (cis-působící RNA struktury) umístěné v 5-netranslatované oblasti mRNA mohou modulovat přerušení nebo předčasné ukončení transkripce. Mohou regulovat jak transkripci, tak translaci ligand-dependentním způsobem a slouží jako vynikající modelový systém pro zkoumání koordinace spojené transkripce-translace. Zde používáme pre-queuosine1 (PreQ1) riboswitch, abychom pochopili koordinaci iniciace translace a pozastaveni RNA polymerázy (RNAP) během transkripce. Použitím kryo-elektronove mikroskopie zkoumáme mechanismus zavádění mRNA na malou ribozomální podjednotku (30S) a koordinaci iniciace translace a elongace transkripce. Naším specifickým cílem je pochopit dynamiku vazby 30S na mRNA riboswitch obsahující ribozomální vazebné místo, tvorbu a stabilizaci pre-iniciačního komplexu a následné přechodné interakce během počátečních kroků spojení transkripce-translace.
Návaznosti
LL2008, projekt VaVNázev: Komunikace mezi transkripcí a translací (Akronym: CROSSBETT)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Komunikace mezi transkripcí a translací
VytisknoutZobrazeno: 8. 8. 2024 05:56