NEŠPOR DADEJOVÁ, Martina, Michal FRANEK a Martina DVOŘÁČKOVÁ. Laser microirradiation as a versatile system for probing protein recruitment and protein-protein interactions at DNA lesions in plants. New Phytologist. Blackwell Science, 2022, roč. 234, č. 5, s. 1891-1900. ISSN 0028-646X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/nph.18086.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Laser microirradiation as a versatile system for probing protein recruitment and protein-protein interactions at DNA lesions in plants
Autoři NEŠPOR DADEJOVÁ, Martina (203 Česká republika, domácí), Michal FRANEK (703 Slovensko, domácí) a Martina DVOŘÁČKOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání New Phytologist, Blackwell Science, 2022, 0028-646X.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10611 Plant sciences, botany
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 9.400
Kód RIV RIV/00216224:14740/22:00127898
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1111/nph.18086
UT WoS 000785919300001
Klíčová slova anglicky Arabidopsis; BiFC; DNA damage; DNA repair; microirradiation; PCNA; protoplasts
Štítky CF CELLIM, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 1. 2023 16:59.
Anotace
Plant protoplasts are generated by treatment with digestion enzymes, producing plant cells devoid of the cell wall and competent for efficient polyethylene glycol mediated transformation. This way fluorescently tagged proteins can be introduced to the protoplasts creating an excellent system to probe the localization and function of uncharacterized plant proteins in vivo. We implement the method of laser microirradiation to generate DNA lesions in Arabidopsis thaliana, which enables monitoring the recruitment and dynamics of the DNA repair factors as well as bimolecular fluorescence complementation assay to test transient, conditional interactions of proteins directly at sites of DNA damage. We demonstrate that laser microirradiation in protoplasts yields a physiological cellular response to DNA lesions, based on proliferating cell nuclear antigen (PCNA) redistribution in the nucleus and show that factors involved in DNA repair, such as MRE11 or PCNA are recruited to induced DNA lesions. This technique is relatively easy to adopt by other laboratories and extends the current toolkit of methods aimed to understand the details of DNA damage response in plants. The presented method is fast, flexible and facilitates work with different mutant backgrounds or even different species, extending the utility of the system.
Návaznosti
EF16_026/0008446, projekt VaVNázev: Integrace signálu a epigenetické reprogramování pro produktivitu rostlin
GJ19-11880Y, projekt VaVNázev: Chromatinové prostředí indukované genotoxickými látkami
Investor: Grantová agentura ČR, Chromatinové prostředí indukované genotoxickými látkami
LM2018129, projekt VaVNázev: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování Czech-BioImaging
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, National research infrastructure for biological and medical imaging
LTC18048, projekt VaVNázev: Prostorové uspořádání významných jaderných domén a jejich proteinových složek
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Prostorové uspořádání významných jaderných domén a jejich proteinových složek, INTER-COST
LTC20003, projekt VaVNázev: Dynamics of telomeres and rDNA loci in plant cell nuclei
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamics of telomeres and rDNA loci in plant cell nuclei, INTER-COST
VytisknoutZobrazeno: 28. 7. 2024 12:17