Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot
Gregor Johann Mendel

J 2022

Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot Gregor Johann Mendel

CHOCHOLOVÁ, Eva, Eva DROZDOVÁ, Dana FIALOVÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL et. al.

Základní údaje

Originální název

Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot Gregor Johann Mendel

Autoři

CHOCHOLOVÁ, Eva (203 Česká republika, garant, domácí), Eva DROZDOVÁ (203 Česká republika, domácí), Dana FIALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Pavel ROUDNICKÝ (203 Česká republika, domácí), Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, domácí), Barbora ZWINSOVÁ (203 Česká republika, domácí), Kateřina NOVOTNÁ (203 Česká republika, domácí), Filip PARDY (203 Česká republika, domácí), Jakub HYNŠT (203 Česká republika, domácí), Marek PEŠKA (203 Česká republika), Antonín ZŮBEK (203 Česká republika), Kateřina MRÁZOVÁ, Vladislav KRZYŽÁNEK (203 Česká republika), Michael DOUBEK (203 Česká republika, domácí) a Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Folia Mendeliana : supplementum ad Acta Musei Moraviae, Moravian Museum Brno, 2022, 0085-0748

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Kód RIV

RIV/00216224:14310/22:00128536

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

Gregor Johann Mendel; oral microbiome; dental calculus; palaeoproteomics; palaeogenomics; periodontitis

Příznaky

Mezinárodní význam

Změněno: 27. 4. 2023 16:43, Mgr. Eva Chocholová

Anotace

V originále

As part of the interdisciplinary research of abbot and founder of genetics, Gregor Johann Mendel, his dental calculus was sampled to gain insight into his health that could not be obtained by mere genome sequencing. A total of 469 proteins were found after filtering, including proteins related to immunity and oral health. Multiple oral species connected to dental pathology such as periodontitis were confirmed based on both DNA and proteins, originating from Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythia, or Treponema denticola. High abundance of Clostridiales DNA was confirmed, in agreement with mummification by saponification.

Návaznosti

LM2015085, projekt VaV

Název: CERIT Scientific Cloud (Akronym: CERIT-SC)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CERIT Scientific Cloud

LM2018127, projekt VaV

Název: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology

LM2018132, projekt VaV

Název: Národní centrum lékařské genomiky (Akronym: NCLG)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní centrum lékařské genomiky

LM2018140, projekt VaV

Název: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ

MUNI/A/1325/2021, interní kód MU

Název: Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 10 (Akronym: MBG10)

Investor: Masarykova univerzita, Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 10

Citovat

CHOCHOLOVÁ, Eva, Eva DROZDOVÁ, Dana FIALOVÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL, Barbora ZWINSOVÁ, Kateřina NOVOTNÁ, Filip PARDY, Jakub HYNŠT, Marek PEŠKA, Antonín ZŮBEK, Kateřina MRÁZOVÁ, Vladislav KRZYŽÁNEK, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot Gregor Johann Mendel. Folia Mendeliana : supplementum ad Acta Musei Moraviae. Moravian Museum Brno, 2022, roč. 58, č. 1, s. 57-61. ISSN 0085-0748.

@article{2252433,
   author = {Chocholová, Eva and Drozdová, Eva and Fialová, Dana and Roudnický, Pavel and Zdráhal, Zbyněk and Zwinsová, Barbora and Novotná, Kateřina and Pardy, Filip and Hynšt, Jakub and Peška, Marek and Zůbek, Antonín and Mrázová, Kateřina and Krzyžánek, Vladislav and Doubek, Michael and Pospíšilová, Šárka},
   article_number = {1},
   keywords = {Gregor Johann Mendel; oral microbiome; dental calculus; palaeoproteomics; palaeogenomics; periodontitis},
   language = {eng},
   issn = {0085-0748},
   journal = {Folia Mendeliana : supplementum ad Acta Musei Moraviae},
   title = {Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot Gregor Johann Mendel},
   url = {http://www.mzm.cz/e-shop?ai%5Baction%5D=list&ai%5Bcontroller%5D=Catalog&ai%5Bf_catid%5D=23&ai%5Bf_name%5D=Folia-Mendeliana},
   volume = {58},
   year = {2022}
}

TY  - JOUR
ID  - 2252433
AU  - Chocholová, Eva - Drozdová, Eva - Fialová, Dana - Roudnický, Pavel - Zdráhal, Zbyněk - Zwinsová, Barbora - Novotná, Kateřina - Pardy, Filip - Hynšt, Jakub - Peška, Marek - Zůbek, Antonín - Mrázová, Kateřina - Krzyžánek, Vladislav - Doubek, Michael - Pospíšilová, Šárka
PY  - 2022
TI  - Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot Gregor Johann Mendel
JF  - Folia Mendeliana : supplementum ad Acta Musei Moraviae
VL  - 58
IS  - 1
SP  - 57-61
EP  - 57-61
PB  - Moravian Museum Brno
SN  - 00850748
KW  - Gregor Johann Mendel
KW  - oral microbiome
KW  - dental calculus
KW  - palaeoproteomics
KW  - palaeogenomics
KW  - periodontitis
UR  - http://www.mzm.cz/e-shop?ai%5Baction%5D=list&ai%5Bcontroller%5D=Catalog&ai%5Bf_catid%5D=23&ai%5Bf_name%5D=Folia-Mendeliana
N2  - As part of the interdisciplinary research of abbot and founder of genetics, Gregor Johann Mendel, his dental calculus was sampled to gain insight into his health that could not be obtained by mere genome sequencing. A total of 469 proteins were found after filtering, including proteins related to immunity and oral health. Multiple oral species connected to dental pathology such as periodontitis were confirmed based on both DNA and proteins, originating from Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythia, or Treponema denticola. High abundance of Clostridiales DNA was confirmed, in agreement with mummification by saponification.
ER  -

CHOCHOLOVÁ, Eva, Eva DROZDOVÁ, Dana FIALOVÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL, Barbora ZWINSOVÁ, Kateřina NOVOTNÁ, Filip PARDY, Jakub HYNŠT, Marek PEŠKA, Antonín ZŮBEK, Kateřina MRÁZOVÁ, Vladislav KRZYŽÁNEK, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot Gregor Johann Mendel. \textit{Folia Mendeliana : supplementum ad Acta Musei Moraviae}. Moravian Museum Brno, 2022, roč.~58, č.~1, s.~57-61. ISSN~0085-0748.

Podrobný výpis o publikaci