Orální bakteriom u pacientů s dlaždicobuněčným karcinomem dle stavu jejich dentice: pilotní studie

GACHOVÁ, Daniela, Zdeněk DANĚK, Ctirad MACHÁČEK, Soňa SMETANOVÁ, Petr ANDRLA, Eva BUDINSKÁ a Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Orální bakteriom u pacientů s dlaždicobuněčným karcinomem dle stavu jejich dentice: pilotní studie. In ONCO Prague, 2023. 2023.

Základní údaje

• Originální název: Orální bakteriom u pacientů s dlaždicobuněčným karcinomem dle stavu jejich dentice: pilotní studie
• Název anglicky: Oral bacterioma in patients with squamous cell carcinoma based on their gingival status: a pilot study
• Autoři: GACHOVÁ, Daniela (203 Česká republika), Zdeněk DANĚK (203 Česká republika), Ctirad MACHÁČEK (203 Česká republika), Soňa SMETANOVÁ (203 Česká republika), Petr ANDRLA (203 Česká republika), Eva BUDINSKÁ (703 Slovensko) a Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: ONCO Prague, 2023, 2023.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 10608 Biochemistry and molecular biology
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14110/23:00130315
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• Klíčová slova anglicky: bacterioma; squamous cell carcinoma; pilot study

Anotace

Úvod: Orální dlaždicobuněčný karcinom (OSCC) je nejčastější malignitou v oblasti hlavy a krku. Mezi faktory, jež ovlivňují etiopatogenezi OSCC se řadí mj. orální dysbióza a malhygiena. Ve srovnání s ozubenými mají lidé s úplnou ztrátou zubů (podobně jako lidé s dobrou orální hygienou) méně diverzní orální bakteriom. Ve studiích kontrol a případů byla pozorována významně větší bakteriální diverzita na povrchu tumoru u pacientů s OSCC ve srovnání se vzorky zdravé orální mukózy u kontrol. Cílem této pilotní studie bylo analyzovat a srovnat bakteriom na povrchu tumoru a z dentálního plaku a zjistit, zda se bakteriální osídlení povrchu tumoru liší v závislosti na stavu dentice u pacientů s OSCC. Metody: 32 pacientů s histopatologicky potvrzenou diagnózou OSCC jsme rozdělili do 3 skupin dle stavu jejich dentice na bezzubé, málo ozubené (<16 zubů) a více ozubené (≥16 zubů). U všech byl odebrán stěr z povrchu tumoru a u ozubených navíc i stěr dentálního plaku. Mikrobiální DNA jsme izolovali pomocí kitu QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN), a dále jsme provedli amplifikaci hypervariabilní oblasti 16S rRNA a připravili knihovnu pro sekvenování nové generace na přístroji Illumina MiSeq. Výsledky: Alfa diverzita bakteriomu byla srovnatelná v matricích získaných stěrem z tumoru a dentálního plaku (p > 0,05). V obou typech vzorků patřily mezi jedny z nejvíce zastoupených rodů Streptococcus, Fusobacterium a Porphyromonas. Nalezli jsme rozdíl v bakteriální diverzitě (dle ASV) z povrchu tumoru při porovnání bezzubých pacientů a pacientů málo ozubených (<16 zubů; p < 0,05); u více ozubených pacientů jsme pozorovali pouze obdobný trend (p > 0,05). Relativní abundance rodu Dialister sp. na povrchu tumoru byla vyšší u málo ozubených ve srovnání s více ozubenými pacienty (p < 0,05), zatímco mezi bezzubými a málo ozubenými nebyl v tomto rozdíl (p > 0,05). Úroveň orální hygieny i počet ASV u vzorků dentálního plaku byli podobné mezi skupinami ozubených pacientů (p > 0,05). Shrnutí: Výsledky naší pilotní studie ukázaly, že pacienti zcela bez zubů mají nižší bakteriální diverzitu na povrchu tumoru než ti ozubení. To potvrzuje hypotézu, že orální bakteriom u pacientů s OSCC je ovlivněn stavem jejich dentice.

Anotace anglicky

Introduction: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is the most common malignancy in the head and neck region. Factors influencing the etiopathogenesis of OSCC include oral dysbiosis and malhygiene. Compared to dentate people, people with complete tooth loss (similar to people with good oral hygiene) have less oral bacteriomyoma diversion. In studies of controls and cases, significantly greater bacterial diversity was observed on the tumor surface in patients with OSCC compared to healthy oral mucosa samples in controls. The aim of this pilot study was to analyze and compare the bacteriome on the tumor surface and from the dental plaque and to determine whether the bacterial colonization of the tumor surface differs according to the status of the dentition in patients with OSCC. Methods: Thirty-two patients with a histopathologically confirmed diagnosis of OSCC were divided into 3 groups according to the condition of their dentition into edentulous, under-edentulous (<16 teeth), and over-edentulous (≥16 teeth). In all of them, a swab was taken from the tumor surface and in the dentate ones, in addition, a dental plaque swab was taken. Microbial DNA was isolated using the QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN), and the 16S rRNA hypervariable region was amplified and a library was prepared for next-generation sequencing on an Illumina MiSeq instrument. Results: The alpha diversity of the bacteriome was comparable in matrices obtained from tumor and dental plaque swabs (p > 0.05). In both types of samples, Streptococcus, Fusobacterium and Porphyromonas were among the most abundant genera. We found a difference in bacterial diversity (according to ASV) from the tumor surface when comparing edentulous and low-toothed patients (<16 teeth; p < 0.05); we observed only a similar trend in the more toothed patients (p > 0.05). The relative abundance of the genus Dialister sp. on the tumor surface was higher in the low-toothed compared to the more toothed patients (p < 0.05), whereas there was no difference between the no- and low-toothed patients (p > 0.05). The level of oral hygiene and the number of ASV in the dental plaque samples were similar between the toothed patient groups (p > 0.05). Summary: The results of our pilot study showed that completely edentulous patients had lower bacterial diversity on the tumor surface than the edentulous ones. This supports the hypothesis that the oral bacteriome in OSCC patients is influenced by the condition of their dentition.

Návaznosti

• LM2018121, projekt VaV: Název: Výzkumná infrastruktura RECETOX (Akronym: RECETOX RI)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, RECETOX RI

• LM2018132, projekt VaV: Název: Národní centrum lékařské genomiky (Akronym: NCLG)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní centrum lékařské genomiky