Single Cerebral Organoid Mass Spectrometry of Cell-Specific Protein and Glycosphingolipid Traits

NEZVEDOVÁ, Markéta, Durga JHA, Tereza VÁŇOVÁ, Darshak Chandulal GADARA, Hana KLÍMOVÁ, Jan RAŠKA, Lukáš OPÁLKA, Dáša BOHAČIAKOVÁ a Zdeněk SPÁČIL. Single Cerebral Organoid Mass Spectrometry of Cell-Specific Protein and Glycosphingolipid Traits. Analytical Chemistry. American Chemical Society, 2023, roč. 95, č. 6, s. 3160-3167. ISSN 0003-2700. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.2c00981.

Základní údaje

• Originální název: Single Cerebral Organoid Mass Spectrometry of Cell-Specific Protein and Glycosphingolipid Traits
• Autoři: NEZVEDOVÁ, Markéta (203 Česká republika, domácí), Durga JHA (356 Indie, domácí), Tereza VÁŇOVÁ (203 Česká republika, domácí), Darshak Chandulal GADARA (356 Indie, domácí), Hana KLÍMOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jan RAŠKA (203 Česká republika, domácí), Lukáš OPÁLKA, Dáša BOHAČIAKOVÁ (703 Slovensko, domácí) a Zdeněk SPÁČIL (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: Analytical Chemistry, American Chemical Society, 2023, 0003-2700.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 10601 Cell biology
• Stát vydavatele: Spojené státy
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: DOI
• Impakt faktor: Impact factor: 7.400 v roce 2022
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/23:00130378
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• Doi: http://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.2c00981
• UT WoS: 000927047200001
• Klíčová slova anglicky: Assays; Cells; Differentiation; Lipids; Peptides and proteins
• Štítky: 14110517, rivok
• Příznaky: Mezinárodní význam, Recenzováno

Anotace

Cerebral organoids are a prolific research topic and an emerging model system for neurological diseases in human neurobiology. However, the batch-to-batch reproducibility of current cultivation protocols is challenging and thus requires a high-throughput methodology to comprehensively characterize cerebral organoid cytoarchitecture and neural development. We report a mass spectrometry-based protocol to quantify neural tissue cell markers, cell surface lipids, and housekeeping proteins in a single organoid. Profiled traits probe the development of neural stem cells, radial glial cells, neurons, and astrocytes. We assessed the cell population heterogeneity in individually profiled organoids in the early and late neurogenesis stages. Here, we present a unifying view of cell-type specificity of profiled protein and lipid traits in neural tissue. Our workflow characterizes the cytoarchitecture, differentiation stage, and batch cultivation variation on an individual cerebral organoid level.

Návaznosti

• EF17_043/0009632, projekt VaV: Název: CETOCOEN Excellence
• GA20-15728S, projekt VaV: Název: Nové přístupy k překonání terapeutické rezistence u glioblastoma multiforme se zaměřením na buněčnou senescenci a model mozkového organoidu

Investor: Grantová agentura ČR, Nové přístupy k překonání terapeutické rezistence u glioblastoma multiforme se zaměřením na buněčnou senescenci a model mozkového organoidu

• GA21-21510S, projekt VaV: Název: Studium molekulárních mechanismů vzniku Alzheimerovy choroby pomocí cerebrálních organoidů (Akronym: AD Brain Organoids)

Investor: Grantová agentura ČR, Uncovering molecular mechanisms of Alzheimer’s disease initiation using brain organoids

• GJ18-25429Y, projekt VaV: Název: Funkční studie mikroRNA u nerálních kmenových buněk v průběhu diferenciace

Investor: Grantová agentura ČR, Funkční studie mikroRNA u nerálních kmenových buněk v průběhu diferenciace

• LM2018121, projekt VaV: Název: Výzkumná infrastruktura RECETOX (Akronym: RECETOX RI)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, RECETOX RI

• MUNI/G/1131/2017, interní kód MU: Název: Transformative stem cell-based model of Alzheimer’s disease and advanced analytics to study the role of membrane lipids in the pathogenesis

Investor: Masarykova univerzita, Transformative stem cell-based model of Alzheimer’s disease and advanced analytics to study the role of membrane lipids in the pathogenesis, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty

• MUNI/R/1697/2020, interní kód MU: Název: Career Restart - Stem Cell-Based Models of Neurodegeneration

Investor: Masarykova univerzita, Career Restart - Stem Cell-Based Models of Neurodegeneration, CAREER RESTART

• NV19-08-00472, projekt VaV: Název: Klinicky relevantní biochemické, imunologické a buněčné biomarkery Alzheimerovy nemoci a stárnutí (Akronym: BioMAD)

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Klinicky relevantní biochemické, imunologické a buněčné biomarkery Alzheimerovy nemoci a stárnutí

• ROZV/23/LF/2019, interní kód MU: Název: LF - Příspěvek na IP 2019

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, LF - Příspěvek na IP 2019, Interní rozvojové projekty

• ROZV/28/LF/2020, interní kód MU: Název: LF - Příspěvek na InstP 2020

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, LF - Příspěvek na InstP 2020, Interní rozvojové projekty

• 857560, interní kód MU(Kód CEP: EF17_043/0009632): Název: CETOCOEN Excellence (Akronym: CETOCOEN Excellence)

Investor: Evropská unie, CETOCOEN Excellence, Spreading excellence and widening participation