j 2023

An Evaluation of EDAM Coverage in the Tools Ecosystem and Prototype Integration of Galaxy and Workflowhub Systems.

LAMOTHE, Lucie, Jennifer R B JENSEN, Hans IENASESCU, Ove J R GUSTAFSSON, Alban GAIGNARD et. al.

Základní údaje

Originální název

An Evaluation of EDAM Coverage in the Tools Ecosystem and Prototype Integration of Galaxy and Workflowhub Systems.

Autoři

LAMOTHE, Lucie (garant), Jennifer R B JENSEN, Hans IENASESCU, Ove J R GUSTAFSSON, Alban GAIGNARD, Dmitry REPCHEVSKY, Radka SVOBODOVÁ (203 Česká republika, domácí), Tomáš RAČEK (203 Česká republika, domácí), Adrián ROŠINEC (703 Slovensko, domácí), Matej ANTOL (703 Slovensko, domácí) a Hervé MÉNAGER

Vydání

BioHackrXiv, 2023

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný)

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Kód RIV

RIV/00216224:14740/23:00131062

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

Klíčová slova anglicky

metadata; Tools Ecosystem; Galaxy workflows

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 30. 3. 2024 10:31, Mgr. Eva Dubská

Anotace

V originále

Here we report the results of a project started at the BioHackathon Europe 2022. Its goals were to cross-compare and analyze the metadata centralized in the Tools Ecosystem, and linked to the EDAM ontology, as well as to explore methods for connecting tools used in registered Galaxy workflows (i.e. WorkflowHub entries) to the annotations available in bio.tools.

Návaznosti

LM2023055, projekt VaV
Název: Česká národní infrastruktura pro biologická data
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, ELIXIR-CZ: Česká národní infrastruktura pro biologická data