2023
In-depth analysis of biocatalysts by microfluidics: An emerging source of data for machine learning
VAŠINA, Michal, David KOVÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ, Ding YUN, Tianjin YANG et. al.Základní údaje
Originální název
In-depth analysis of biocatalysts by microfluidics: An emerging source of data for machine learning
Autoři
VAŠINA, Michal (203 Česká republika, domácí), David KOVÁŘ (203 Česká republika, domácí), Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí), Ding YUN, Tianjin YANG, Andrew DE MELLO, Stanislav MAZURENKO (643 Rusko, domácí), Stavros STAVRAKIS a Zbyněk PROKOP (203 Česká republika, domácí)
Vydání
Biotechnology Advances, OXFORD, Elsevier, 2023, 0734-9750
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
20800 2.8 Environmental biotechnology
Stát vydavatele
Velká Británie a Severní Irsko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 16.000 v roce 2022
Kód RIV
RIV/00216224:14310/23:00131491
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
001009341400001
Klíčová slova anglicky
Enzyme; Biochemical characterization; Biotechnology; Catalytic activity; Thermostability; Steady-state kinetics; Protein crystallography; Big data; Protein engineering; Artificial intelligence
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 30. 1. 2024 10:30, prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Anotace
V originále
Nowadays, the vastly increasing demand for novel biotechnological products is supported by the continuous development of biocatalytic applications that provide sustainable green alternatives to chemical processes. The success of a biocatalytic application is critically dependent on how quickly we can identify and characterize enzyme variants fitting the conditions of industrial processes. While miniaturization and parallelization have dramatically increased the throughput of next-generation sequencing systems, the subsequent characterization of the obtained candidates is still a limiting process in identifying the desired biocatalysts. Only a few commercial microfluidic systems for enzyme analysis are currently available, and the transformation of numerous published prototypes into commercial platforms is still to be streamlined. This review presents the state-of-the-art, recent trends, and perspectives in applying microfluidic tools in the functional and structural analysis of biocatalysts. We discuss the advantages and disadvantages of available technologies, their reproducibility and robustness, and readiness for routine laboratory use. We also highlight the unexplored potential of microfluidics to leverage the power of machine learning for biocatalyst development.
Návaznosti
EF17_043/0009632, projekt VaV |
| ||
LM2018121, projekt VaV |
| ||
LM2018131, projekt VaV |
| ||
LX22NPO5102, projekt VaV |
| ||
814418, interní kód MU |
| ||
857560, interní kód MU (Kód CEP: EF17_043/0009632) |
|