a 2023

Palaeoproteomic and Genomic Analyses of Bronze Age Population from Unětice Culture, Moravia, Czech Republic

CHOCHOLOVÁ, Eva, Anna ŠENOVSKÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL, Kristýna BRZOBOHATÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Palaeoproteomic and Genomic Analyses of Bronze Age Population from Unětice Culture, Moravia, Czech Republic

Autoři

CHOCHOLOVÁ, Eva (203 Česká republika, garant, domácí), Anna ŠENOVSKÁ (203 Česká republika, domácí), Pavel ROUDNICKÝ (203 Česká republika, domácí), Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, domácí), Kristýna BRZOBOHATÁ (203 Česká republika, domácí), Dana FIALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Petr KOS (203 Česká republika) a Eva DROZDOVÁ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

10th Meeting of the International Society for Biomolecular Archaeology, New Horizons in Biomolecular Archaeology, 2023

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/23:00131733

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova česky

Metagenomika; 16S rRNA; paleoproteomika; starobylá DNA; aDNA; doba bronzová; mitogenom; Únětice

Klíčová slova anglicky

Metagenomics; 16S rRNA; palaeoproteomics; ancient DNA; aDNA; Bronze Age; Mitogenome; Únětice

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 19. 9. 2023 15:47, Mgr. Eva Chocholová

Anotace

V originále

Mitogenome research offers an intriguing insight into the history, origin, contacts, and variability of past populations and has become a standard part of the study of past populations. Ancient dental calculus is also a well-known and valuable source of information that is used to investigate health, diet, migrations, or habits in the context of biomolecular archaeology. The studied individuals were excavated at a Bronze Age site of Brno-Tuřany, Moravia region, Czech Republic. They belonged to the Unětice culture, dated to 2300-1600 BC. For the present study, we decided to combine both approaches: genomic analysis of mitochondrial DNA in 16 individuals and proteomic analysis of dental calculus in 8 individuals. Sampling, decontamination, ancient DNA extraction, library preparation, and the first stages of protein extraction were carried out in the specialised facility for ancient biomolecules in the Laboratory of Biological and Molecular Anthropology. DNA was purified using silica columns and the whole mitogenome libraries were prepared according to Šenovská et al. (2021) with mtDNA capture. The proteins were extracted with the FASP protocol modified for ancient biomolecules. LC-MS/MS analysis was performed on timsTOF Pro combined with nanoElute (Bruker). Based on mtDNA, the population from Brno-Tuřany was very variable and six general haplogroups were found: N (1), W (1), H (4), V (2), K (1), and the most frequent U (7). No shared haplotype occurred between the studied individuals. The identified dietary proteins originated from, e.g. Bos sp., Ovis/Capra sp., Triticum aestivum or Brassica sp. The biomolecular approach in archaeology therefore offers new insights into past populations.

Návaznosti

LM2015091, projekt VaV
Název: Národní centrum lékařské genomiky (Akronym: NCLG)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní centrum lékařské genomiky
LM2018140, projekt VaV
Název: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
LM2023042, projekt VaV
Název: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CIISB - Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii
MUNI/A/1325/2021, interní kód MU
Název: Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 10 (Akronym: MBG10)
Investor: Masarykova univerzita, Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 10