Shedding light on the black box of a neural network used to detect prostate cancer in whole slide images by occlusion-based explainability

GALLO, Matej, Vojtěch KRAJŇANSKÝ, Rudolf NENUTIL, Petr HOLUB a Tomáš BRÁZDIL. Shedding light on the black box of a neural network used to detect prostate cancer in whole slide images by occlusion-based explainability. NEW BIOTECHNOLOGY. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 78, December, s. 52-67. ISSN 1871-6784. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.nbt.2023.09.008.

Základní údaje

Originální název

Shedding light on the black box of a neural network used to detect prostate cancer in whole slide images by occlusion-based explainability

Autoři

GALLO, Matej (703 Slovensko, domácí), Vojtěch KRAJŇANSKÝ (203 Česká republika, domácí), Rudolf NENUTIL (203 Česká republika), Petr HOLUB (203 Česká republika, domácí) a Tomáš BRÁZDIL (203 Česká republika, domácí)

Vydání

NEW BIOTECHNOLOGY, NETHERLANDS, ELSEVIER, 2023, 1871-6784

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Nizozemské království

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 5.400 v roce 2022

Kód RIV

RIV/00216224:14330/23:00131902

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

DOI

http://dx.doi.org/10.1016/j.nbt.2023.09.008

UT WoS

001102047400001

Klíčová slova anglicky

Artificial intelligence; Digital histopathology; Explainable AI; Machine learning; Occlusion sensitivity analysis; Prostate cancer

---

Anotace

V originále

• Saliency maps identified histomorphological features characterizing cancer. • VGG16 model utilized all the structures that are observable by the pathologist. • The method can identify standard patterns not used by the model. • The method can also identify new patterns not yet used by human pathologists.

---

Návaznosti

LM2018140, projekt VaV	Název: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
MUNI/A/0854/2017, interní kód MU	Název: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace VII. Investor: Masarykova univerzita, Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace VII., DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/A/1195/2021, interní kód MU	Název: Aplikovaný výzkum v oblastech vyhledávání, analýz a vizualizací rozsáhlých dat, zpracování přirozeného jazyka a aplikované umělé inteligence Investor: Masarykova univerzita, Aplikovaný výzkum v oblastech vyhledávání, analýz a vizualizací rozsáhlých dat, zpracování přirozeného jazyka a aplikované umělé inteligence
MUNI/A/1339/2022, interní kód MU	Název: Rozvoj technik pro zpracování dat pro podporu vyhledávání, analýz a vizualizací rozsáhlých datových souborů s využitím umělé inteligence Investor: Masarykova univerzita, Rozvoj technik pro zpracování dat pro podporu vyhledávání, analýz a vizualizací rozsáhlých datových souborů s využitím umělé inteligence