Rapid identification of pathogens in blood serum via Raman
tweezers in combination with advanced processing methods

J 2023

Rapid identification of pathogens in blood serum via Raman tweezers in combination with advanced processing methods

VACULÍK, Ondřej, Silvie BERNATOVÁ, Katarína REBROŠOVÁ, Ota SAMEK, Lukáš ŠILHAN et. al.

Základní údaje

Originální název

Rapid identification of pathogens in blood serum via Raman tweezers in combination with advanced processing methods

Autoři

VACULÍK, Ondřej (203 Česká republika), Silvie BERNATOVÁ (203 Česká republika), Katarína REBROŠOVÁ (703 Slovensko, domácí), Ota SAMEK (203 Česká republika), Lukáš ŠILHAN (203 Česká republika), Filip RŮŽIČKA (203 Česká republika, domácí), Mojmír ŠERÝ (203 Česká republika), Martin ŠILER (203 Česká republika), Jan JEŽEK (203 Česká republika) a Pavel ZEMÁNEK (203 Česká republika)

Vydání

Biomedical Optics Express, WASHINGTON, OPTICA PUBLISHING GROUP, 2023, 2156-7085

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10606 Microbiology

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 3.400 v roce 2022

Kód RIV

RIV/00216224:14110/23:00134679

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.1364/BOE.503628

UT WoS

001123729400003

Klíčová slova anglicky

Raman tweezers; blood serum; pathogens

Štítky

14110113, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 26. 1. 2024 09:11, Mgr. Tereza Miškechová

Anotace

V originále

Pathogenic microbes contribute to several major global diseases that kill millions of people every year. Bloodstream infections caused by these microbes are associated with high morbidity and mortality rates, which are among the most common causes of hospitalizations. The search for the “Holy Grail” in clinical diagnostic microbiology, a reliable, accurate, low cost, real-time, and easy-to-use diagnostic method, is one of the essential issues in clinical practice. These very critical conditions can be met by Raman tweezers in combination with advanced analysis methods. Here, we present a proof-of-concept study based on Raman tweezers combined with spectral mixture analysis that allows for the identification of microbial strains directly from human blood serum without user intervention, thus eliminating the influence of a data analyst.

Návaznosti

NU21-05-00341, projekt VaV

Název: Pokročilé metody detekce patogenních mikroorganizmů a hodnocení účinku antimikrobiálních látek Ramanovou spektroskopií a dalšími metodami na úrovni molekul v optofluidních systémech

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Pokročilé metody detekce patogenních mikroorganizmů a hodnocení účinku antimikrobiálních látek Ramanovou spektroskopií a dalšími metodami na úrovni molekul v optofluidních systémech, Podprogram 1 - standardní

Citovat

VACULÍK, Ondřej, Silvie BERNATOVÁ, Katarína REBROŠOVÁ, Ota SAMEK, Lukáš ŠILHAN, Filip RŮŽIČKA, Mojmír ŠERÝ, Martin ŠILER, Jan JEŽEK a Pavel ZEMÁNEK. Rapid identification of pathogens in blood serum via Raman tweezers in combination with advanced processing methods. Biomedical Optics Express. WASHINGTON: OPTICA PUBLISHING GROUP, 2023, roč. 14, č. 12, s. 6410-6421. ISSN 2156-7085. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1364/BOE.503628.

@article{2343978,
   author = {Vaculík, Ondřej and Bernatová, Silvie and Rebrošová, Katarína and Samek, Ota and Šilhan, Lukáš and Růžička, Filip and Šerý, Mojmír and Šiler, Martin and Ježek, Jan and Zemánek, Pavel},
   article_location = {WASHINGTON},
   article_number = {12},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1364/BOE.503628},
   keywords = {Raman tweezers; blood serum; pathogens},
   language = {eng},
   issn = {2156-7085},
   journal = {Biomedical Optics Express},
   title = {Rapid identification of pathogens in blood serum via Raman tweezers in combination with advanced processing methods},
   url = {https://opg.optica.org/boe/fulltext.cfm?uri=boe-14-12-6410&id=542842#},
   volume = {14},
   year = {2023}
}

TY  - JOUR
ID  - 2343978
AU  - Vaculík, Ondřej - Bernatová, Silvie - Rebrošová, Katarína - Samek, Ota - Šilhan, Lukáš - Růžička, Filip - Šerý, Mojmír - Šiler, Martin - Ježek, Jan - Zemánek, Pavel
PY  - 2023
TI  - Rapid identification of pathogens in blood serum via Raman tweezers in combination with advanced processing methods
JF  - Biomedical Optics Express
VL  - 14
IS  - 12
SP  - 6410-6421
EP  - 6410-6421
PB  - OPTICA PUBLISHING GROUP
SN  - 21567085
KW  - Raman tweezers
KW  - blood serum
KW  - pathogens
UR  - https://opg.optica.org/boe/fulltext.cfm?uri=boe-14-12-6410&id=542842#
N2  - Pathogenic microbes contribute to several major global diseases that kill millions of people every year. Bloodstream infections caused by these microbes are associated with high morbidity and mortality rates, which are among the most common causes of hospitalizations. The search for the “Holy Grail” in clinical diagnostic microbiology, a reliable, accurate, low cost, real-time, and easy-to-use diagnostic method, is one of the essential issues in clinical practice. These very critical conditions can be met by Raman tweezers in combination with advanced analysis methods. Here, we present a proof-of-concept study based on Raman tweezers combined with spectral mixture analysis that allows for the identification of microbial strains directly from human blood serum without user intervention, thus eliminating the influence of a data analyst.
ER  -

VACULÍK, Ondřej, Silvie BERNATOVÁ, Katarína REBROŠOVÁ, Ota SAMEK, Lukáš ŠILHAN, Filip RŮŽIČKA, Mojmír ŠERÝ, Martin ŠILER, Jan JEŽEK a Pavel ZEMÁNEK. Rapid identification of pathogens in blood serum via Raman tweezers in combination with advanced processing methods. \textit{Biomedical Optics Express}. WASHINGTON: OPTICA PUBLISHING GROUP, 2023, roč.~14, č.~12, s.~6410-6421. ISSN~2156-7085. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1364/BOE.503628.

Podrobný výpis o publikaci