PAPAGEORGIOU, Anna, Michaela POSPÍŠILOVÁ, Jakub CIBULKA, Raghib ASHRAF, Christopher WAUDBY, Pavel KADEŘÁVEK, Volha MAROZ, Karel KUBÍČEK, Zbyněk PROKOP, Lumír KREJČÍ a Konstantinos TRIPSIANES. Recognition and coacervation of G-quadruplexes by a multifunctional disordered region in RECQ4 helicase. Nature Communications. Berlin: Nature, 2023, roč. 14, č. 1, s. 1-19. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-42503-z.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Recognition and coacervation of G-quadruplexes by a multifunctional disordered region in RECQ4 helicase
Autoři PAPAGEORGIOU, Anna (300 Řecko, domácí), Michaela POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jakub CIBULKA (203 Česká republika, domácí), Raghib ASHRAF (356 Indie, domácí), Christopher WAUDBY, Pavel KADEŘÁVEK (203 Česká republika, domácí), Volha MAROZ (203 Česká republika, domácí), Karel KUBÍČEK (203 Česká republika, domácí), Zbyněk PROKOP (203 Česká republika, domácí), Lumír KREJČÍ (203 Česká republika, domácí) a Konstantinos TRIPSIANES (300 Řecko, garant, domácí).
Vydání Nature Communications, Berlin, Nature, 2023, 2041-1723.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10300 1.3 Physical sciences
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 16.600 v roce 2022
Kód RIV RIV/00216224:14740/23:00134740
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-42503-z
UT WoS 001089230100015
Klíčová slova anglicky Biomolecular polyelectrolyte complexes; DNA helicase Q4; G-quadruplexes; intrinsically disordered regions; RPA protein
Štítky 14110513, CF BIC, CF NMR, podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 2. 5. 2024 10:57.
Anotace
Biomolecular polyelectrolyte complexes can be formed between oppositely charged intrinsically disordered regions (IDRs) of proteins or between IDRs and nucleic acids. Highly charged IDRs are abundant in the nucleus, yet few have been functionally characterized. Here, we show that a positively charged IDR within the human ATP-dependent DNA helicase Q4 (RECQ4) forms coacervates with G-quadruplexes (G4s). We describe a three-step model of charge-driven coacervation by integrating equilibrium and kinetic binding data in a global numerical model. The oppositely charged IDR and G4 molecules form a complex in the solution that follows a rapid nucleation-growth mechanism leading to a dynamic equilibrium between dilute and condensed phases. We also discover a physical interaction with Replication Protein A (RPA) and demonstrate that the IDR can switch between the two extremes of the structural continuum of complexes. The structural, kinetic, and thermodynamic profile of its interactions revealed a dynamic disordered complex with nucleic acids and a static ordered complex with RPA protein. The two mutually exclusive binding modes suggest a regulatory role for the IDR in RECQ4 function by enabling molecular handoffs. Our study extends the functional repertoire of IDRs and demonstrates a role of polyelectrolyte complexes involved in G4 binding.
Návaznosti
EF17_043/0009632, projekt VaVNázev: CETOCOEN Excellence
EF18_070/0009846, projekt VaVNázev: MSCAfellow2@MUNI
GA23-06913S, projekt VaVNázev: Pochopení vztahu strukturně uspořádaných a neuspořádaných částí proteinu Dishevellled pro jeho funkci v signalizaci Wnt
Investor: Grantová agentura ČR, Pochopení procesů vnitřní uspořádanosti a neuspořádanosti pro funkci proteinu Dishevelled a signalizaci Wnt
GX21-22593X, projekt VaVNázev: Identifikace a charakterizace proteinů zahrnutých v metabolismu G-kvadruplexů a R-smyček a jejich vztah k replikaci DNA
LM2023042, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CIISB - Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii
MUNI/A/1393/2022, interní kód MUNázev: Biomedicínské vědy III
Investor: Masarykova univerzita, Biomedicínské vědy III
MUNI/G/1594/2019, interní kód MUNázev: RecQ4 – a protein hub required for proper replication and recombination and its implications in Rothmund-Thomson Syndrome
Investor: Masarykova univerzita, RecQ4 – a protein hub required for proper replication and recombination and its implications in Rothmund-Thomson Syndrome, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty
206292/E/17/Z, interní kód MUNázev: Mechanics and execution of homologous recombination - biophysics to the organism
Investor: Wellcome Trust, Mechanics and execution of homologous recombination - biophysics to the organism
857560, interní kód MU
(Kód CEP: EF17_043/0009632)
Název: CETOCOEN Excellence (Akronym: CETOCOEN Excellence)
Investor: Evropská unie, CETOCOEN Excellence, Spreading excellence and widening participation
Typ Název Vložil/a Vloženo Práva
2344400.pdf Licence Creative Commons  Verze souboru Hylsová, M. 15. 12. 2023

Vlastnosti

Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2344400/2344400.pdf
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2344400/2344400.pdf
Adresa do Správce
https://is.muni.cz/auth/publication/2344400/2344400.pdf?info
Ze světa do Správce
https://is.muni.cz/publication/2344400/2344400.pdf?info
Vloženo
Pá 15. 12. 2023 20:18, Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D.

Práva

Právo číst
  • kdokoliv v Internetu
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D., učo 106653
  • osoba Konstantinos Tripsianes, Ph.D., učo 119435
  • osoba doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D., učo 18098
  • osoba doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD., učo 20563
  • osoba prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D., učo 23696
  • osoba Anna Papageorgiou, Ph.D., MSc, učo 237995
  • osoba Mgr. Jakub Cibulka, PhD., učo 244150
  • osoba Mgr. Michaela Pospíšilová, učo 436900
  • osoba Raghib Ashraf, učo 466478
  • osoba Bc. Volha Maroz, učo 479465
  • osoba Mgr. Eva Dubská, učo 77638
Atributy
 

2344400.pdf

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2344400/2344400.pdf
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2344400/2344400.pdf
Typ souboru
PDF (application/pdf)
Velikost
3 MB
Hash md5
b1f262a8a6d9a07c7cbe236d0faf5be7
Vloženo
Pá 15. 12. 2023 20:18

2344400_Archive.pdf

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2344400/2344400_Archive.pdf
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2344400/2344400_Archive.pdf
Typ souboru
PDF/A (application/x-pdf)
Velikost
15,3 MB
Hash md5
61940397e75b9e42b0b9403aa947cf19
Vloženo
Pá 15. 12. 2023 20:32

2344400.txt

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2344400/2344400.txt
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2344400/2344400.txt
Typ souboru
holý text (text/plain)
Velikost
168,7 KB
Hash md5
3de8d691921c5c0d22c266b668c86965
Vloženo
Pá 15. 12. 2023 20:35
Vytisknout
Nahlásit neoprávněně vložený soubor Zobrazeno: 31. 5. 2024 10:54