a 2023

Transmembrane glycoprotein GPNMB is a potential marker of poor response of metastatic renal cell carcinoma to tyrosine kinase receptor inhibitor treatment

ŠIMONÍK, Jan, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC et. al.

Základní údaje

Originální název

Transmembrane glycoprotein GPNMB is a potential marker of poor response of metastatic renal cell carcinoma to tyrosine kinase receptor inhibitor treatment

Autoři

ŠIMONÍK, Jan (203 Česká republika, domácí), Pavla BOUCHALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Petr LAPČÍK (203 Česká republika, domácí), David POTĚŠIL (203 Česká republika, domácí), Ján PODHOREC (703 Slovensko, domácí), Lucia JANÁČOVÁ (703 Slovensko, domácí), Alice HLOBILKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Vlad POPOVICI (642 Rumunsko, domácí), Alexandr POPRACH (203 Česká republika, domácí), Milan HORA (203 Česká republika, domácí), Ondřej FIALA (203 Česká republika) a Pavel BOUCHAL (203 Česká republika, domácí)

Vydání

9th Informal Proteomic Meeting November 30 – December 1, Mělník, Masaryk Cultural House, 2023

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/23:00132430

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

Transmembrane glycoprotein GPNMB; metastatic renal cell carcinoma; tyrosine kinase receptor inhibitor treatment
Změněno: 5. 4. 2024 09:58, Mgr. Tereza Miškechová

Anotace

V originále

Metastatic renal cell carcinoma (mRCC) represents a systemic disease with a very poor prognosis. A targeted therapy with receptor tyrosine kinase inhibitors (rTKI) has been used in the first-line treatment of mRCC patients with good or intermediate prognosis for many years. However, about half of the patients respond poorly or do not respond to this treatment, and there is no clinical marker identifying these non-responders. To understand the molecular mechanisms associated with a poor response to rTKI and to identify patients who would benefit from an alternate treatment (e.g. immunotherapy or clinical trial), we performed a retrospective proteomics study on 53 mRCC tumors treated with rTKI (23 responders/30 non-responders) using next-generation, data-independent acquisition (DIA) mass spectrometry with a consistent quantification of 5977 protein groups (FDR 0.01). Analysis of differential protein abundance identified a panel of 12 proteins associated with treatment response, of which 5 were successfully validated in an independent cohort of 22 mRCC tumors (10 responders /12 non-responders). Of these, transmembrane glycoprotein GPNMB exhibited the best predictive value (AUC.5=0.756, p=4.733.10 -10 ), was associated with the time to response (p=0.048), and the trend of increased GPNMB protein levels was visible in another independent cohort (n=40) using immunohistochemistry. To investigate the potential of GPNMB to serve as an alternative therapeutic target in mRCC, we knocked out its expression using CRISPR/Cas9 in 786-0 cell line derived from RCC. Comparison of parental and GPNMB -/- cells showed that higher GPNMB protein level supports migration capacity of RCC cells in the scratch assay (p=0.0073) and Transwell assay (p < 0.0001), and supports cell invasiveness in Transwell assay (p=0.0009) and 3D invasion assay (p < 0.0001). In summary, GPNMB has the potential to serve as a biomarker of a poor mRCC response to rTKI treatment and potentially also as a therapeutic target in mRCC non-responding to rTKI as an alternative to TKI and potentially immunotherapy treatment.

Návaznosti

LM2018129, projekt VaV
Název: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování Czech-BioImaging
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, National research infrastructure for biological and medical imaging
LM2023042, projekt VaV
Název: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CIISB - Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii
LX22NPO5102, projekt VaV
Název: Národní ústav pro výzkum rakoviny (Akronym: NÚVR)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní ústav pro výzkum rakoviny, 5.1 EXCELES
MUNI/A/1313/2022, interní kód MU
Název: Podpora biochemického výzkumu v roce 2023
Investor: Masarykova univerzita, Podpora biochemického výzkumu v roce 2023
NV19-08-00250, projekt VaV
Název: Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi