HAŠANOVÁ, Zdenka, Veronika KLÁPŠŤOVÁ, Odil PORRUA, Richard ŠTEFL a Marek ŠEBESTA. Human senataxin is a bona fide R-loop resolving enzyme and transcription termination factor. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 2023, roč. 51, č. 6, s. 2818-2837. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad092.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Human senataxin is a bona fide R-loop resolving enzyme and transcription termination factor
Autoři HAŠANOVÁ, Zdenka (703 Slovensko, domácí), Veronika KLÁPŠŤOVÁ (203 Česká republika, domácí), Odil PORRUA, Richard ŠTEFL (203 Česká republika, garant, domácí) a Marek ŠEBESTA (703 Slovensko, domácí).
Vydání Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2023, 0305-1048.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 14.900 v roce 2022
Kód RIV RIV/00216224:14740/23:00132763
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad092
UT WoS 000942750600001
Klíčová slova anglicky RNA-POLYMERASE-II; OCULOMOTOR APRAXIA TYPE-2; SACCHAROMYCES-CEREVISIAE SEN1; GENOME INSTABILITY; REPLICATION CONFLICTS; RNA/DNA HYBRIDS; PAUSE SITES; INFO-RNA; HELICASE; ATAXIA
Štítky CF BIC, CF PROT, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 4. 2024 19:32.
Anotace
Prolonged pausing of the transcription machinery may lead to the formation of three-stranded nucleic acid structures, called R-loops, typically resulting from the annealing of the nascent RNA with the template DNA. Unscheduled persistence of R-loops and RNA polymerases may interfere with transcription itself and other essential processes such as DNA replication and repair. Senataxin (SETX) is a putative helicase, mutated in two neurodegenerative disorders, which has been implicated in the control of R-loop accumulation and in transcription termination. However, understanding the precise role of SETX in these processes has been precluded by the absence of a direct characterisation of SETX biochemical activities. Here, we purify and characterise the helicase domain of SETX in parallel with its yeast orthologue, Sen1. Importantly, we show that SETX is a bona fide helicase with the ability to resolve R-loops. Furthermore, SETX has retained the transcription termination activity of Sen1 but functions in a species-specific manner. Finally, subsequent characterisation of two SETX variants harbouring disease-associated mutations shed light into the effect of such mutations on SETX folding and biochemical properties. Altogether, these results broaden our understanding of SETX function in gene expression and the maintenance of genome integrity and provide clues to elucidate the molecular basis of SETX-associated neurodegenerative diseases.
Návaznosti
EF18_046/0015974, projekt VaVNázev: Modernizace České infrastruktury pro integrativní strukturní biologii
GM21-10464M, projekt VaVNázev: Strukturní charakterizace interakcí mezi transkripcí a opravou DNA
Investor: Grantová agentura ČR, Structural characterisation of the interplay between transcription and DNA repair
LM2018127, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
649030, interní kód MUNázev: DECOR - Dynamic assembly and exchange of RNA polymerase II CTD factors (Akronym: DECOR)
Investor: Evropská unie, DECOR - Dynamic assembly and exchange of RNA polymerase II CTD factors, ERC (Excellent Science)
90242, velká výzkumná infrastrukturaNázev: CIISB III
VytisknoutZobrazeno: 28. 4. 2024 15:22