LELKES, Edit, Jitka JEMELKOVÁ, Marcela HOLÁ, Barbora ŠTEFANOVIE, Peter KOLESÁR, Radka VÁGNEROVÁ, Eva DVOŘÁK TOMAŠTÍKOVÁ, Aleš PEČINKA, Karel J. ANGELIS a Jan PALEČEK. Characterization of the conserved features of the NSE6 subunit of the Physcomitrium patens PpSMC5/6 complex. PLANT JOURNAL. ENGLAND: WILEY, 2023, roč. 115, č. 4, s. 1084-1099. ISSN 0960-7412. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/tpj.16282.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Characterization of the conserved features of the NSE6 subunit of the Physcomitrium patens PpSMC5/6 complex
Název česky Charakterizace konzervovaných vlastností NSE6 podjednotky Physcomitrium patens komplexu PpSMC5/6
Autoři LELKES, Edit (703 Slovensko, domácí), Jitka JEMELKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Marcela HOLÁ (203 Česká republika), Barbora ŠTEFANOVIE (703 Slovensko, domácí), Peter KOLESÁR (703 Slovensko, domácí), Radka VÁGNEROVÁ (203 Česká republika), Eva DVOŘÁK TOMAŠTÍKOVÁ (203 Česká republika), Aleš PEČINKA (203 Česká republika), Karel J. ANGELIS (203 Česká republika) a Jan PALEČEK (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání PLANT JOURNAL, ENGLAND, WILEY, 2023, 0960-7412.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 7.200 v roce 2022
Kód RIV RIV/00216224:14310/23:00132792
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1111/tpj.16282
UT WoS 000995683100001
Klíčová slova anglicky SMC5/6 complex; NSE5/SNI1/SLF1/SIMC1; NSE6/ASAP1/SLF2/KRE29; CANIN domain; DNA damage repair; plant development; Physcomitrium patens
Štítky protein-protein interactions, rivok, SMC5-6 complex
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 19. 1. 2024 10:43.
Anotace
Structural maintenance of chromosomes (SMC) complexes are molecular machines ensuring chromatin organization at higher levels. They play direct roles in cohesion, condensation, replication, transcription, and DNA repair. Their cores are composed of long-armed SMC, kleisin, and kleisin-associated subunits. Additional factors, like NSE6 within SMC5/6, bind to SMC core complexes and regulate their activities. In the human HsNSE6/SLF2, we recently identified a new CANIN domain. Here we tracked down its sequence homology to lower plants, selected the bryophyte Physcomitrium patens, and analyzed PpNSE6 protein-protein interactions to explore its conservation in detail. We identified a previously unrecognized core sequence motif conserved from yeasts to humans within the NSE6 CANIN domain. This motif mediates the interaction between NSE6 and its NSE5 partner in yeasts and plants. In addition, the CANIN domain and its preceding PpNSE6 sequences bind both PpSMC5 and PpSMC6 arms. Interestingly, we mapped the PpNSE6-binding site at the PpSMC5 arm right next to the PpNSE2-binding surface. The position of NSE6 at SMC arms suggests its role in the regulation of SMC5/6 dynamics. Consistent with the regulatory role of NSE6 subunits, Ppnse6 mutant lines were viable and sensitive to the DNA-damaging drug bleomycin and lost a large portion of rDNA copies. These moss mutants also exhibited reduced growth and developmental aberrations. Altogether, our data showed the conserved function of the NSE6 subunit and architecture of the SMC5/6 complex across species.
Návaznosti
GA20-05095S, projekt VaVNázev: Úloha komplexu SMC5/6 a jeho interakčních partnerů v opravě poškozené DNA (Akronym: SMC5/6)
Investor: Grantová agentura ČR, Úloha komplexu SMC5/6 a jeho interakčních partnerů v opravě poškozené DNA
LM2018129, projekt VaVNázev: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování Czech-BioImaging
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, National research infrastructure for biological and medical imaging
MUNI/R/1142/2021, interní kód MUNázev: Visualization of the 3D structure of chromatin
Investor: Masarykova univerzita, Visualization of the 3D structure of chromatin, CAREER RESTART
MUNI/R/1262/2022, interní kód MUNázev: Vztah mezi opravou DNA a transkripcí
Investor: Masarykova univerzita, Vztah mezi opravou DNA a transkripcí, CAREER RESTART
VytisknoutZobrazeno: 23. 9. 2024 02:56