| BOUCHAL, Pavel, Jan ŠIMONÍK, Richard ŠTEFANÍK, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH a Ondřej FIALA. Proteotypová klasifikace renálního karcinomu. In Sborník abstrakt (Klinická onkologie, ročník 36, Supplementum I), XLVII. Brněnské onkologické dny, Brno, CZ, 1.-3.11.2023, XXXI/81. 2023. |
Další formáty:
BibTeX
LaTeX
RIS
@misc{2358237,
author = {Bouchal, Pavel and Šimoník, Jan and Štefaník, Richard and Bouchalová, Pavla and Lapčík, Petr and Potěšil, David and Podhorec, Ján and Hora, Milan and Poprach, Alexandr and Fiala, Ondřej},
booktitle = {Sborník abstrakt (Klinická onkologie, ročník 36, Supplementum I), XLVII. Brněnské onkologické dny, Brno, CZ, 1.-3.11.2023, XXXI/81},
keywords = {localized and metastatic renal cell carcinoma; tyrosine kinase inhibitors; response to treatment; relapse; prognosis},
language = {cze},
title = {Proteotypová klasifikace renálního karcinomu},
url = {http://www.onkologickedny.cz},
year = {2023}
}
TY - SLIDE
ID - 2358237
AU - Bouchal, Pavel - Šimoník, Jan - Štefaník, Richard - Bouchalová, Pavla - Lapčík, Petr - Potěšil, David - Podhorec, Ján - Hora, Milan - Poprach, Alexandr - Fiala, Ondřej
PY - 2023
TI - Proteotypová klasifikace renálního karcinomu
KW - localized and metastatic renal cell carcinoma
KW - tyrosine kinase inhibitors
KW - response to treatment
KW - relapse
KW - prognosis
UR - http://www.onkologickedny.cz
N2 - Renální karcinom (RCC) představuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově druhou nejvyšší incidencí v České republice. Molekulární prognostické a prediktivní biomarkery pro RCC jsou většinově nedostupné, především pak na proteinové úrovni. Pro kvantifikaci co největšího množství proteinů spojených s tumorigenezí RCC jsme vytvořili RCC-specifickou spektrální knihovnu cílených proteomických “assays“ pro 7960 proteinových skupin (FDR=1 %). Následně jsme použili hmotnostní spektrometrii s datově nezávislým sběrem dat (DIA-MS) na LC-MS systému QExactive HF-X pro analýzu velmi dobře charakterizovaného souboru metastatických RCC tumorů (tréninkový soubor n=53, validační soubor n=22) a přilehlých nenádorových tkání (n=17), z nichž část odpovídala a část neodpovídala na léčbu tyrosinkinázovými inhibitory (TKI). Identifikovali a validovali jsme proteinový biomarker specificky spojený se špatnou odpovědí na léčbu TKI, související rovněž s časem do dosažení nejlepší léčebné odpovědi a nesouvisející s nádorovým grade a dalšími klinickopatologickými parametry. Funkční analýzy s využitím CRISPR/Cas9 knockoutu potvrdily jeho souvislost s buněčnou migrací a invazivitou ve 2D a 3D prostředí. Podobná studie byla provedena také pro identifikaci proteinů souvisejících s relapsem lokalizovaného RCC a rovněž vedla k relevantním výsledkům. Lze shrnout, že proteomika nové generace založená na DIA-MS je vysoce výkonným nástrojem pro klasifikaci tkání RCC, umožňující identifikaci prognostických biomarkerů a alternativních terapeutických cílů. Podpořeno Ministerstvem zdravotnictví ČR, projekt č. NV19-08-00250, všechna práva vyhrazena. Podpořeno projektem Národní ústav pro výzkum rakoviny (Program EXCELES, ID Projekt č. LX22NPO5102) - Financováno Evropskou unií - Next Generation EU.
ER -
BOUCHAL, Pavel, Jan ŠIMONÍK, Richard ŠTEFANÍK, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH a Ondřej FIALA. Proteotypová klasifikace renálního karcinomu. In \textit{Sborník abstrakt (Klinická onkologie, ročník 36, Supplementum I), XLVII. Brněnské onkologické dny, Brno, CZ, 1.-3.11.2023, XXXI/81}. 2023.
|
