2023
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu
BOUCHAL, Pavel, Jan ŠIMONÍK, Richard ŠTEFANÍK, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK et. al.Základní údaje
Originální název
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu
Název anglicky
Proteotype classification of renal cell carcinoma
Autoři
BOUCHAL, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí), Jan ŠIMONÍK (203 Česká republika), Richard ŠTEFANÍK (203 Česká republika, domácí), Pavla BOUCHALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Petr LAPČÍK (203 Česká republika, domácí), David POTĚŠIL (203 Česká republika, domácí), Ján PODHOREC (703 Slovensko, domácí), Milan HORA (203 Česká republika), Alexandr POPRACH (203 Česká republika) a Ondřej FIALA (203 Česká republika)
Vydání
Sborník abstrakt (Klinická onkologie, ročník 36, Supplementum I), XLVII. Brněnské onkologické dny, Brno, CZ, 1.-3.11.2023, XXXI/81, 2023
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Vyžádané přednášky
Obor
10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Kód RIV
RIV/00216224:14310/23:00132864
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova česky
lokalizovaný a metastatický renální karcinom; tyrosin kinázové inhibitory; odpověď na léčbu; relaps; prognóza
Klíčová slova anglicky
localized and metastatic renal cell carcinoma; tyrosine kinase inhibitors; response to treatment; relapse; prognosis
Změněno: 5. 4. 2024 09:50, Mgr. Tereza Miškechová
V originále
Renální karcinom (RCC) představuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově druhou nejvyšší incidencí v České republice. Molekulární prognostické a prediktivní biomarkery pro RCC jsou většinově nedostupné, především pak na proteinové úrovni. Pro kvantifikaci co největšího množství proteinů spojených s tumorigenezí RCC jsme vytvořili RCC-specifickou spektrální knihovnu cílených proteomických “assays“ pro 7960 proteinových skupin (FDR=1 %). Následně jsme použili hmotnostní spektrometrii s datově nezávislým sběrem dat (DIA-MS) na LC-MS systému QExactive HF-X pro analýzu velmi dobře charakterizovaného souboru metastatických RCC tumorů (tréninkový soubor n=53, validační soubor n=22) a přilehlých nenádorových tkání (n=17), z nichž část odpovídala a část neodpovídala na léčbu tyrosinkinázovými inhibitory (TKI). Identifikovali a validovali jsme proteinový biomarker specificky spojený se špatnou odpovědí na léčbu TKI, související rovněž s časem do dosažení nejlepší léčebné odpovědi a nesouvisející s nádorovým grade a dalšími klinickopatologickými parametry. Funkční analýzy s využitím CRISPR/Cas9 knockoutu potvrdily jeho souvislost s buněčnou migrací a invazivitou ve 2D a 3D prostředí. Podobná studie byla provedena také pro identifikaci proteinů souvisejících s relapsem lokalizovaného RCC a rovněž vedla k relevantním výsledkům. Lze shrnout, že proteomika nové generace založená na DIA-MS je vysoce výkonným nástrojem pro klasifikaci tkání RCC, umožňující identifikaci prognostických biomarkerů a alternativních terapeutických cílů. Podpořeno Ministerstvem zdravotnictví ČR, projekt č. NV19-08-00250, všechna práva vyhrazena. Podpořeno projektem Národní ústav pro výzkum rakoviny (Program EXCELES, ID Projekt č. LX22NPO5102) - Financováno Evropskou unií - Next Generation EU.
Anglicky
Renal cell carcinoma (RCC) is a serious cancer with the second highest incidence worldwide in the Czech Republic. Molecular prognostic and predictive biomarkers for RCC are mostly unavailable, especially at the protein level.
Návaznosti
| LX22NPO5102, projekt VaV |
| ||
| NV19-08-00250, projekt VaV |
|