MIKULÁŠKOVÁ, Eva, Tomáš PETERKA, Jakub ŠMERDA a Michal HÁJEK. Next-generation sequencing reveals hidden genomic diversity in glacial relicts: A case study of Meesia triquetra. Journal of Systematics and Evolution. Hoboken: Wiley, 2024, roč. 62, č. 3, s. 475-488. ISSN 1674-4918. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/jse.13005.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Next-generation sequencing reveals hidden genomic diversity in glacial relicts: A case study of Meesia triquetra
Autoři MIKULÁŠKOVÁ, Eva (203 Česká republika, garant, domácí), Tomáš PETERKA (203 Česká republika, domácí), Jakub ŠMERDA (203 Česká republika, domácí) a Michal HÁJEK (203 Česká republika, domácí).
Vydání Journal of Systematics and Evolution, Hoboken, Wiley, 2024, 1674-4918.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.700 v roce 2022
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1111/jse.13005
UT WoS 001089015500001
Klíčová slova anglicky bryophyta; cryptic speciation; endangered moss; Europe; morphometry; north–south gradient; RAD-seq; rich fen
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 24. 5. 2024 14:07.
Anotace
The recent development of genetic methods has facilitated the identification of cryptic species across different groups of organisms, including plants. However, next-generation sequencing has rarely been used to study cryptic speciation in plants, especially in bryophytes, organisms with a dominant haploid life phase. The ability to capture variation across the whole genome makes this method an effective tool for distinguishing cryptic lineages. We have focused on the genetic structure of the moss Meesia triquetra along the Alps-to-Scandinavia transect. We detected the presence of the two genetically critically different lineages of M. triquetra in Europe. These lineages overlap in both morphological characters of the gametophyte and distribution ranges. However, they considerably differ in ecological preferences to groundwater pH. While lineage 1 occupied alkaline to subneutral fens, lineage 2 occurred in fens saturated with neutral to acidic water. We consider the entities cryptic species with respect to genetic and ecological differences but the absence of morphological features necessary for determining the entities. We hypothesize that fragmentation of the ancestral population of the moss in geographically isolated refugia differing in the commonness of acidic and alkaline substrates led to consequent long-term adaptation to different environmental conditions, then drove diversification in M. triquetra.
Návaznosti
GJ19-20530Y, projekt VaVNázev: Současná refugia ohrožených slatiništních rostlin a určující faktory jejich genetické diverzity napříč širokým gradientem propojenosti biotopů (Akronym: Refugia slatiništních rostlin)
Investor: Grantová agentura ČR, Současná refugia ohrožených slatiništních rostlin a určující faktory jejich genetické diverzity napříč širokým gradientem propojenosti biotopů
LM2018140, projekt VaVNázev: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
VytisknoutZobrazeno: 17. 7. 2024 03:39