Laboratoře analýzy mikrobiomu - ušní, nasální a orální bakteriom

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Eva KLVAŇOVÁ, Michal BARTOŠ, Milan URÍK, Zuzana MARINČÁK VRANKOVÁ, Pavel HORNÍK, Petra BRENEROVÁ, Lenka BODOKYOVÁ, Pavla HOLOCHOVÁ, Jana VRZALOVÁ, Jan BÖHM, Vojtěch BARTOŇ, Petra RŮŽIČKOVÁ a Jana KLÁNOVÁ. Laboratoře analýzy mikrobiomu - ušní, nasální a orální bakteriom. In Otologický den. 2023.

Základní údaje

• Originální název: Laboratoře analýzy mikrobiomu - ušní, nasální a orální bakteriom
• Název anglicky: Laboratories for microbiome analysis - ear, nasal, and oral bacteriome
• Autoři: BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra (203 Česká republika, garant, domácí), Eva KLVAŇOVÁ (203 Česká republika), Michal BARTOŠ (203 Česká republika), Milan URÍK (703 Slovensko), Zuzana MARINČÁK VRANKOVÁ (703 Slovensko), Pavel HORNÍK (203 Česká republika), Petra BRENEROVÁ (203 Česká republika), Lenka BODOKYOVÁ (703 Slovensko), Pavla HOLOCHOVÁ (203 Česká republika), Jana VRZALOVÁ (203 Česká republika), Jan BÖHM (203 Česká republika), Vojtěch BARTOŇ (203 Česká republika), Petra RŮŽIČKOVÁ (203 Česká republika) a Jana KLÁNOVÁ (203 Česká republika).
• Vydání: Otologický den, 2023.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 10608 Biochemistry and molecular biology
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/23:00133572
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• Klíčová slova anglicky: infrastructure; microbiome

Anotace

Výzkumná činnost centra RECETOX je podporována nejmodernější výzkumnou infrastrukturou, která je částečně centralizovaná do samostatných jednotek, tzv. core facilit. Výzkumná infrastruktura funguje na principu „open access“, v rámci kterého poskytuje své kapacity interním i externím uživatelům z akademické i průmyslové sféry. Součástí našich Centrálních laboratoří je také core facilita Laboratoře analýzy mikrobiomu, ve které se zabýváme analýzou mikrobiomu humánních, animálních i environmentálních vzorků, a to s využitím moderních metod sekvenování nové generace. Kromě vlastní analýzy vzorků, nabízíme i pomoc s designem metagenomických studií, vyhodnocením a interpretací sekvenačních dat. Lidský mikrobiom, neboli soubor genetické informace mikrobioty, je specifický pro lokalitu, ze které pochází. V orofaciální oblasti je dosud nejvíce prostudován orální mikrobiom, v době pandemie Covid-19 se významně více studií začalo věnovat mikrobiomu nasálnímu a nasopharyngeálnímu. Mezi mikrobiomem dutiny ústní a nosní a mikrobiomem ucha mohou být specifické vztahy, kdy dochází k vzájemnému ovlivnění, především pak u malých dětí. Mikrobiom ucha, nejen vnějšího ale i středního, je předmětem zájmu našeho výzkumu u pacientů s akutní nebo s chronickou otitis media.

Anotace anglicky

The research activities of the RECETOX Centre are supported by state-of-the-art research infrastructure, which is partially centralised in separate units, the so-called core facilities. The research infrastructure operates on the principle of "open access", providing its capacity to internal and external users from both academia and industry. Our Central Laboratories also include a core facility, the Microbiome Analysis Laboratory, where we analyse the microbiome of human, animal and environmental samples using modern next-generation sequencing methods. In addition to actual sample analysis, we offer assistance with metagenomic study design, evaluation and interpretation of sequencing data. The human microbiome, or the set of genetic information of the microbiota, is specific to the location from which it originates. In the orofacial region, the oral microbiome has been the most studied to date, with significantly more studies beginning to focus on the nasal and nasopharyngeal microbiome at the time of the Covid-19 pandemic. There may be specific relationships between the oral and nasal microbiome and the ear microbiome, where there are interactions, particularly in young children. The microbiome of the ear, not only the external but also the middle ear, has been the focus of our research in patients with acute or chronic otitis media.

Návaznosti

• EF17_043/0009632, projekt VaV: Název: CETOCOEN Excellence
• LM2023069, projekt VaV: Název: Výzkumná infrastruktura RECETOX

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumná infrastruktura RECETOX