LUX, Filip a Petr MATULA. Cell Tracking based on Integer Linear Programming and Probability Scores. In Athens, Greece, IEEE 21th International Symposium on Biomedical Imaging. Athens: IEEE 21th International Symposium on Biomedical Imaging, 2024, 5 s. ISSN 1945-7928.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Cell Tracking based on Integer Linear Programming and Probability Scores
Autoři LUX, Filip a Petr MATULA.
Vydání Athens, Athens, Greece, IEEE 21th International Symposium on Biomedical Imaging, 5 s. 2024.
Nakladatel IEEE 21th International Symposium on Biomedical Imaging
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISSN 1945-7928
UT WoS bez WOS
Štítky cbia-web
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: RNDr. Filip Lux, učo 456519. Změněno: 20. 3. 2024 10:15.
Anotace
The cell tracking problem can be formulated as a global optimization problem based on integer linear (IL) programming. The obtained solution depends on the definition of the IL program and the chosen costs of the events considered in the problem formulation. In general, balancing meaningful costs across different events is difficult. To simplify this problem, we propose a cost assignment approach based on probability scores, allowing us to easily interpret the free parameters. The idea is presented based on the BF-C2DL-HSC dataset from the Cell Tracking Challenge. We show our method reaches state-of-the-art performance when evaluating both technical and biological tracking measures.
Návaznosti
GA21-20374S, projekt VaVNázev: Segmentace a sledování buněk se složitým tvarem
Investor: Grantová agentura ČR, Segmentace a sledování buněk se složitým tvarem
LM2023050, projekt VaVNázev: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech BioImaging: Národní výzkumná infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování
MUNI/A/1592/2023, interní kód MUNázev: Modelování, analýza a verifikace (2024)
Investor: Masarykova univerzita, Modelování, analýza a verifikace (2024)
VytisknoutZobrazeno: 19. 7. 2024 12:22