Cell Tracking based on Integer Linear Programming and Probability Scores

LUX, Filip a Petr MATULA. Cell Tracking based on Integer Linear Programming and Probability Scores. In Athens, Greece, IEEE 21th International Symposium on Biomedical Imaging. Athens: IEEE 21th International Symposium on Biomedical Imaging, 2024, s. 1-5. ISBN 979-8-3503-1334-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ISBI56570.2024.10635857.

Základní údaje

Originální název

Cell Tracking based on Integer Linear Programming and Probability Scores

Autoři

LUX, Filip a Petr MATULA

Vydání

Athens, Athens, Greece, IEEE 21th International Symposium on Biomedical Imaging, od s. 1-5, 5 s. 2024

Nakladatel

IEEE 21th International Symposium on Biomedical Imaging

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

979-8-3503-1334-5

ISSN

DOI

http://dx.doi.org/10.1109/ISBI56570.2024.10635857

UT WoS

bez WOS

Štítky

cbia-web

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

The cell tracking problem can be formulated as a global optimization problem based on integer linear (IL) programming. The obtained solution depends on the definition of the IL program and the chosen costs of the events considered in the problem formulation. In general, balancing meaningful costs across different events is difficult. To simplify this problem, we propose a cost assignment approach based on probability scores, allowing us to easily interpret the free parameters. The idea is presented based on the BF-C2DL-HSC dataset from the Cell Tracking Challenge. We show our method reaches state-of-the-art performance when evaluating both technical and biological tracking measures.

---

Návaznosti

GA21-20374S, projekt VaV	Název: Segmentace a sledování buněk se složitým tvarem Investor: Grantová agentura ČR, Segmentace a sledování buněk se složitým tvarem
LM2023050, projekt VaV	Název: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech BioImaging: Národní výzkumná infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování
MUNI/A/1592/2023, interní kód MU	Název: Modelování, analýza a verifikace (2024) Investor: Masarykova univerzita, Modelování, analýza a verifikace (2024)