MoaB2, a newly identified transcription factor, binds to σA in
Mycobacterium smegmatis

J 2024

MoaB2, a newly identified transcription factor, binds to σA in Mycobacterium smegmatis

BREZOVSKA, Barbora; Subhash NARASIMHAN; Michaela SIKOVA; Hana SANDEROVA; Tomas KOVAL et al.

Základní údaje

Originální název

MoaB2, a newly identified transcription factor, binds to σA in Mycobacterium smegmatis

Autoři

Vydání

Journal of Bacteriology, Washington, American Society for Microbiology, 2024, 0021-9193

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 3.000

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14740/24:00138935

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

https://doi.org/10.1128/jb.00066-24

UT WoS

001348035500001

EID Scopus

2-s2.0-85213063372

Klíčová slova anglicky

MoaB2; sigma(A); mycobacteria; RNA polymerase; transcription

Štítky

143160, CF BIC, CF NMR, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 8. 12. 2025 10:21, Mgr. Eva Dubská

Anotace

V originále

In mycobacteria, σA is the primary sigma factor. This essential protein binds to RNA polymerase (RNAP) and mediates transcription initiation of housekeeping genes. Our knowledge about this factor in mycobacteria is limited. Here, we performed an unbiased search for interacting partners of Mycobacterium smegmatis σA. The search revealed a number of proteins; prominent among them was MoaB2. The σA-MoaB2 interaction was validated and characterized by several approaches, revealing that it likely does not require RNAP and is specific, as alternative σ factors (e.g., closely related σB) do not interact with MoaB2. The structure of MoaB2 was solved by X-ray crystallography. By immunoprecipitation and nuclear magnetic resonance, the unique, unstructured N-terminal domain of σA was identified to play a role in the σA-MoaB2 interaction. Functional experiments then showed that MoaB2 inhibits σA-dependent (but not σB-dependent) transcription and may increase the stability of σA in the cell. We propose that MoaB2, by sequestering σA, has a potential to modulate gene expression. In summary, this study has uncovered a new binding partner of mycobacterial σA, paving the way for future investigation of this phenomenon.

Návaznosti

EF18_046/0015974, projekt VaV

Název: Modernizace České infrastruktury pro integrativní strukturní biologii

GA19-12956S, projekt VaV

Název: Klíčové aspekty mykobakteriální transkriprce: SigA, podjednotka RNAP rozpoznávající promotor a její nově identifikovaný vazebný partner.

Investor: Grantová agentura ČR, Klíčové aspekty mykobakteriální transkriprce: SigA, podjednotka RNAP rozpoznávající promotor a její nově identifikovaný vazebný partner.

GA22-12023S, projekt VaV

Název: Neuspořádanost proteinových struktur vnáší řád do bakteriální transkripce

Investor: Grantová agentura ČR, Neuspořádanost proteinových struktur vnáší řád do bakteriální transkripce

LM2018127, projekt VaV

Název: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology

LM2018131, projekt VaV

Název: Česká národní infrastruktura pro biologická data (Akronym: ELIXIR-CZ)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Česká národní infrastruktura pro biologická data

LX22NPO5103, projekt VaV

Název: Národní institut virologie a bakteriologie (Akronym: NIVB)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní institut virologie a bakteriologie, 5.1 EXCELES

Přiložené soubory

2480217.pdf

Citovat

BREZOVSKA, Barbora; Subhash NARASIMHAN; Michaela SIKOVA; Hana SANDEROVA; Tomas KOVAL; Nabajyoti BORAH; Mahmoud SHOMAN; Debora POSPISILOVA; Viola Vankova HAUSNEROVA; Dávid TUŽINČIN; Martin ČERNÝ; Jan KOMÁREK; Martina JANOUSKOVA; Milada KAMBOVA; Petr HALADA; Alena KRENKOVA; Martin HUBALEK; Maria TRUNDOVA; Jan DOHNALEK; Jarmila HNILICOVA; Lukáš ŽÍDEK a Libor KRASNY. MoaB2, a newly identified transcription factor, binds to σA in Mycobacterium smegmatis. Journal of Bacteriology. Washington: American Society for Microbiology, 2024, roč. 206, č. 12, s. 1-30. ISSN 0021-9193. Dostupné z: https://doi.org/10.1128/jb.00066-24.

@article{2480217,
   author = {Brezovska, Barbora and Narasimhan, Subhash and Sikova, Michaela and Sanderova, Hana and Koval, Tomas and Borah, Nabajyoti and Shoman, Mahmoud and Pospisilova, Debora and Hausnerova, Viola Vankova and Tužinčin, Dávid and Černý, Martin and Komárek, Jan and Janouskova, Martina and Kambova, Milada and Halada, Petr and Krenkova, Alena and Hubalek, Martin and Trundova, Maria and Dohnalek, Jan and Hnilicova, Jarmila and Žídek, Lukáš and Krasny, Libor},
   article_location = {Washington},
   article_number = {12},
   doi = {https://doi.org/10.1128/jb.00066-24},
   keywords = {MoaB2; sigma(A); mycobacteria; RNA polymerase; transcription},
   language = {eng},
   issn = {0021-9193},
   journal = {Journal of Bacteriology},
   title = {MoaB2, a newly identified transcription factor, binds to σA in Mycobacterium smegmatis},
   url = {https://doi.org/10.1128/jb.00066-24},
   volume = {206},
   year = {2024}
}

TY  - JOUR
ID  - 2480217
AU  - Brezovska, Barbora - Narasimhan, Subhash - Sikova, Michaela - Sanderova, Hana - Koval, Tomas - Borah, Nabajyoti - Shoman, Mahmoud - Pospisilova, Debora - Hausnerova, Viola Vankova - Tužinčin, Dávid - Černý, Martin - Komárek, Jan - Janouskova, Martina - Kambova, Milada - Halada, Petr - Krenkova, Alena - Hubalek, Martin - Trundova, Maria - Dohnalek, Jan - Hnilicova, Jarmila - Žídek, Lukáš - Krasny, Libor
PY  - 2024
TI  - MoaB2, a newly identified transcription factor, binds to σA in Mycobacterium smegmatis
JF  - Journal of Bacteriology
VL  - 206
IS  - 12
SP  - 1-30
EP  - 1-30
PB  - American Society for Microbiology
SN  - 00219193
KW  - MoaB2
KW  - sigma(A)
KW  - mycobacteria
KW  - RNA polymerase
KW  - transcription
UR  - https://doi.org/10.1128/jb.00066-24
N2  - In mycobacteria, σA is the primary sigma factor. This essential protein binds to RNA polymerase (RNAP) and mediates transcription initiation of housekeeping genes. Our knowledge about this factor in mycobacteria is limited. Here, we performed an unbiased search for interacting partners of Mycobacterium smegmatis σA. The search revealed a number of proteins; prominent among them was MoaB2. The σA-MoaB2 interaction was validated and characterized by several approaches, revealing that it likely does not require RNAP and is specific, as alternative σ factors (e.g., closely related σB) do not interact with MoaB2. The structure of MoaB2 was solved by X-ray crystallography. By immunoprecipitation and nuclear magnetic resonance, the unique, unstructured N-terminal domain of σA was identified to play a role in the σA-MoaB2 interaction. Functional experiments then showed that MoaB2 inhibits σA-dependent (but not σB-dependent) transcription and may increase the stability of σA in the cell. We propose that MoaB2, by sequestering σA, has a potential to modulate gene expression. In summary, this study has uncovered a new binding partner of mycobacterial σA, paving the way for future investigation of this phenomenon.
ER  -

BREZOVSKA, Barbora; Subhash NARASIMHAN; Michaela SIKOVA; Hana SANDEROVA; Tomas KOVAL; Nabajyoti BORAH; Mahmoud SHOMAN; Debora POSPISILOVA; Viola Vankova HAUSNEROVA; Dávid TUŽINČIN; Martin ČERNÝ; Jan KOMÁREK; Martina JANOUSKOVA; Milada KAMBOVA; Petr HALADA; Alena KRENKOVA; Martin HUBALEK; Maria TRUNDOVA; Jan DOHNALEK; Jarmila HNILICOVA; Lukáš ŽÍDEK a Libor KRASNY. MoaB2, a newly identified transcription factor, binds to σA in Mycobacterium smegmatis. \textit{Journal of Bacteriology}. Washington: American Society for Microbiology, 2024, roč.~206, č.~12, s.~1-30. ISSN~0021-9193. Dostupné z: https://doi.org/10.1128/jb.00066-24.

Přehled o publikaci