Influence of cell fixation on chromatin topography

KOZUBEK, Stanislav, Emilie LUKÁŠOVÁ, Jana AMRICHOVÁ, Michal KOZUBEK, Andrea LIŠKOVÁ a Jana ŠLOTOVÁ. Influence of cell fixation on chromatin topography. Analytical Biochemistry. San Diego: Academic Press, 2000, roč. 282, č. 1, s. 29-38. ISSN 0003-2697.

Základní údaje

Originální název

Influence of cell fixation on chromatin topography

Autoři

KOZUBEK, Stanislav (203 Česká republika), Emilie LUKÁŠOVÁ (203 Česká republika), Jana AMRICHOVÁ (203 Česká republika), Michal KOZUBEK (203 Česká republika), Andrea LIŠKOVÁ (203 Česká republika) a Jana ŠLOTOVÁ

Vydání

Analytical Biochemistry, San Diego, Academic Press, 2000, 0003-2697

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10610 Biophysics

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

abstract

Impakt faktor

Impact factor: 1.976

Kód RIV

RIV/00216224:14330/00:00002778

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

UT WoS

000087777300005

Klíčová slova anglicky

chromatin structure; cell fixation; confocal laser scanning microscopy; image analysis; interphase nucleus

Štítky

cell fixation, chromatin structure, confocal laser scanning microscopy, Image analysis, interphase nucleus

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

Using in situ hybridization techniques, a fixation step must precede denaturation to prevent disintegration of the chromosomes. The analysis of nuclei fixed by paraformaldehyde, preserving the native structure (three-dimensional or 3D fixation and analysis) has become possible with the development of confocal microscopy; however, the analysis of those fixed by methanol and acetic acid, dehydrating the nuclei (two-dimensional or 2D fixation and analysis), remains a very valuable tool for practical use in diagnostics and also in many cases for research. We compared both types of fixation and analyses using different cell lines and different DNA probes. Fixation of cells by methanol and acetic acid leads to the enlargement of contact of nuclei with the slide surface, resulting in a substantial increase of nuclear diameter, flattening of the nucleus, and consequently to a distortion of gene topology.

---

Návaznosti

GA202/97/0874, projekt VaV	Název: Struktura interfázního jádra a její změny po ozáření Investor: Grantová agentura ČR, Struktura interfázního jádra a její změny po ozáření
MSM 143300002, záměr	Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
NM15, projekt VaV	Název: Užití interfázní FISH techniky pro vyhledávání lidí se zvýšeným rizikem vzniku zhoubných hemoblastóz Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Užití interfázní FISH techniky pro vyhledávání lidí se zvýšeným rizikem vzniku zhoubných hemoblastóz
VS97031, projekt VaV	Název: Využití analýzy obrazu při studiu mechanismů vzniku, v diagnostice a pro prevenci závažných onemocnění člověka Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití analýzy obrazu při studiu mechanismů vzniku, v diagnostice a pro prevenci závažných onemocnění člověka