Makrorestrikční analýza genomu a výskyt profágů u
exfoliatin-pozitivních kmenů Stahylococcus aureus

D 2001

Makrorestrikční analýza genomu a výskyt profágů u exfoliatin-pozitivních kmenů Stahylococcus aureus

RŮŽIČKOVÁ, Vladislava, Jana HRADILOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Jiří DOŠKAŘ et. al.

Základní údaje

Originální název

Makrorestrikční analýza genomu a výskyt profágů u exfoliatin-pozitivních kmenů Stahylococcus aureus

Název anglicky

Macrorestriction analysis of genome and ocurrence prophages in exfoliatin-positive Staphylococcus aureus strains

Autoři

RŮŽIČKOVÁ, Vladislava, Jana HRADILOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ a Jiří DOŠKAŘ

Vydání

Brno, V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, s. 41-41, Sborník příspěvků, 2001

Nakladatel

Masarykova univerzita v Brně

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/01:00004067

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

80-210-2538-7

Klíčová slova anglicky

Staphylococcus aureus; exfoliative toxins; macrorestriction analysis; ribotyping; PCR ribotyping

Štítky

exfoliative toxins, macrorestriction analysis, PCR ribotyping, ribotyping, Staphylococcus aureus

Změněno: 23. 1. 2002 09:16, prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Staphylococcus aureus tvoří exfoliatiny (ETs), které u lidí vyvolávají toxickou epidermolýzu. Ta se projevuje v mírnější formě výsevem kožních puchýřů a v generalizované formě způsobuje tzv. syndrom opařené kůže (SSSS). Genomové DNA 17 exfoliatin-pozitivních kmenů S. aureus izolovaných z pacientů a bacilonosičů byly analyzovány pulzní gelovou elektroforézou (PFGE). Na základě analýzy polymorfismu délky SmaI restrikčních fragmentů byly kmeny rozděleny do pěti PFGE typů: ET1(6 kmenů) ET2 (5 kmenů), ET3 (3 kmeny), ET4 (2 kmeny) a ET5 (1 kmen). Do PFGE typů ET1 a ET4 byly zařazeny izoláty původem z lokality I a do typů ET2, ET3 a ET5 izoláty pocházející z lokality II. Šest kmenů náležejících převládajícímu PFGE typu ET1 měly následující fenotyp: exfoliatin A-pozitivní (ETA+); hemolyzin alfa; citlivost k oxacilinu a fagotyp 71. Jeden kmen z lokality I tvořil vedle ETA enterotoxin C. Z devíti kmenů z lokality II jeden produkoval současně ETA a TSST-1 toxin. Pomocí PCR byly identifikovány geny pro ETA a pro ETB vznikem amplifikačních produktů 119 bp a 200 bp. U tří kmenů, které tvořily ETB současně s exfoliatinem A, byla prokázána lokalizace etb genu na plazmidu. Hybridizací s molekulárními sondami, připravenými ze specifických sekvencí fágů f53 a f77 byla provedena analýza přítomnosti profágů sérologických skupin B a F v genomu ET-pozitivních kmenů S. aureus. Při hybridizaci HindIII a EcoRI spekter se sondou fága 77 byl zjištěn pozitivní signál u dvou kmenů, které náležely PFGE typu ET4 a vykazovaly silnou produkci ETA, jež mohla být výsledkem lyzogenní konverze. Sonda fága 53 hybridizovala s restrikčními fragmenty 94 % kmenů a poskytla různé hybridizační profily signálů v HindIII a EcoRI spektrech. Bylo zjištěno, že s hybridizačními profily obou restrikčních spekter nejvíce koreloval PFGE typ ET3. Závěrem lze konstatovat, že kmeny pocházející ze dvou geograficky vzdálených lokalit byly navzájem geneticky odlišné, přestože měly podobné fenotypové vlastnosti.

Anglicky

in Czech

Návaznosti

MSM 143100008, záměr

Název: Genomy a jejich funkce

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Genomy a jejich funkce

Citovat

RŮŽIČKOVÁ, Vladislava, Jana HRADILOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ a Jiří DOŠKAŘ. Makrorestrikční analýza genomu a výskyt profágů u exfoliatin-pozitivních kmenů Stahylococcus aureus. In V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2001, s. 41. Sborník příspěvků. ISBN 80-210-2538-7.

@inproceedings{351313,
   author = {Růžičková, Vladislava and Hradilová, Jana and Pantůček, Roman and Petráš, Petr and Doškař, Jiří},
   address = {Brno},
   booktitle = {V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů},
   keywords = {Staphylococcus aureus; exfoliative toxins; macrorestriction analysis; ribotyping; PCR ribotyping},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {80-210-2538-7},
   pages = {41-41},
   publisher = {Masarykova univerzita v Brně},
   title = {Makrorestrikční analýza genomu a výskyt profágů u exfoliatin-pozitivních kmenů Stahylococcus aureus},
   year = {2001}
}

TY  - JOUR
ID  - 351313
AU  - Růžičková, Vladislava - Hradilová, Jana - Pantůček, Roman - Petráš, Petr - Doškař, Jiří
PY  - 2001
TI  - Makrorestrikční analýza genomu a výskyt profágů u exfoliatin-pozitivních kmenů Stahylococcus aureus
VL  - Sborník příspěvků
PB  - Masarykova univerzita v Brně
CY  - Brno
SN  - 8021025387
KW  - Staphylococcus aureus
KW  - exfoliative toxins
KW  - macrorestriction analysis
KW  - ribotyping
KW  - PCR ribotyping
N2  - Staphylococcus aureus tvoří exfoliatiny (ETs), které u lidí vyvolávají toxickou epidermolýzu. Ta se projevuje v mírnější formě výsevem kožních puchýřů a v generalizované formě způsobuje tzv. syndrom opařené kůže (SSSS). Genomové DNA 17 exfoliatin-pozitivních kmenů S. aureus izolovaných z pacientů a bacilonosičů byly analyzovány pulzní gelovou elektroforézou (PFGE). Na základě analýzy polymorfismu délky SmaI restrikčních fragmentů byly kmeny rozděleny do pěti PFGE typů: ET1(6 kmenů) ET2 (5 kmenů), ET3 (3 kmeny), ET4 (2 kmeny) a ET5 (1 kmen). Do PFGE typů ET1 a ET4 byly zařazeny izoláty původem z lokality I a do typů ET2, ET3 a ET5 izoláty pocházející z lokality II. Šest kmenů náležejících převládajícímu PFGE typu ET1 měly následující fenotyp: exfoliatin A-pozitivní (ETA+); hemolyzin alfa; citlivost k oxacilinu a fagotyp 71. Jeden kmen z lokality I tvořil vedle ETA enterotoxin C. Z devíti kmenů z lokality II jeden produkoval současně ETA a TSST-1 toxin. Pomocí PCR byly identifikovány geny pro ETA a pro ETB vznikem amplifikačních produktů 119 bp a 200 bp. U tří kmenů, které tvořily ETB současně s exfoliatinem A, byla prokázána lokalizace etb genu na plazmidu. Hybridizací s molekulárními sondami, připravenými ze specifických sekvencí fágů f53 a f77 byla provedena analýza přítomnosti profágů sérologických skupin B a F v genomu ET-pozitivních kmenů S. aureus. Při hybridizaci HindIII a EcoRI spekter se sondou fága 77 byl zjištěn pozitivní signál u dvou kmenů, které náležely PFGE typu ET4 a vykazovaly silnou produkci ETA, jež mohla být výsledkem lyzogenní konverze. Sonda fága 53 hybridizovala s restrikčními fragmenty 94 % kmenů a poskytla různé hybridizační profily signálů v HindIII a EcoRI spektrech. Bylo zjištěno, že s hybridizačními profily obou restrikčních spekter nejvíce koreloval PFGE typ ET3. Závěrem lze konstatovat, že kmeny pocházející ze dvou geograficky vzdálených lokalit byly navzájem geneticky odlišné, přestože měly podobné fenotypové vlastnosti.
ER  -

RŮŽIČKOVÁ, Vladislava, Jana HRADILOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ a Jiří DOŠKAŘ. Makrorestrikční analýza genomu a výskyt profágů u exfoliatin-pozitivních kmenů Stahylococcus aureus. In \textit{V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů}. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2001, s.~41. Sborník příspěvků. ISBN~80-210-2538-7.

Podrobný výpis o publikaci