KŘÍŽ, Zdeněk, Per H.J. CARLSEN a Jaroslav KOČA. Conformational features of linear and cyclic enkephalins. A computational study. Journal of Molecular Structure (Theochem). Netherlands: Elsevier Science, 2001, roč. 540, č. 1, s. 231-250. ISSN 0166-1280.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Conformational features of linear and cyclic enkephalins. A computational study.
Autoři KŘÍŽ, Zdeněk (203 Česká republika), Per H.J. CARLSEN a Jaroslav KOČA (203 Česká republika).
Vydání Journal of Molecular Structure (Theochem), Netherlands, Elsevier Science, 2001, 0166-1280.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10610 Biophysics
Stát vydavatele Nizozemské království
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 0.919
Kód RIV RIV/00216224:14310/01:00004182
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky enkephalins; DLFE; DPDPE; conformational flexibility; clustering
Štítky clustering, conformational flexibility, DLFE, DPDPE, enkephalins
Změnil Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 4. 1. 2004 17:47.
Anotace
A theoretical conformational study using the CICADA program package (J. Mol. Struct. (Theochem), 1995, 337, 17-24) was performed for two linear enkephalins, Leu-enkephalin and Met-enkephalin, and two cyclic analogues, DLFE and DPDPE. The conformational flexibilities of whole molecules and selected torsions were calculated. The low energy conformers obtained were compared with structures obtained by spectroscopic methods. The mutual space positions of key elements for receptor recognition were analyzed. Conformations were clustered using RMS deviation computed for selected atoms. The different conformational behavior of aromatic rings in cyclic analogues of enkephalins was observed. While aromatic rings of cyclic analogues exhibit different conformational behavior, the linear enkephalins show similar behavior in these key parts. Hydrogen bonds predicted by spectroscopic measurements were confirmed by our calculations. Also very specific conformational features, like concerted conformational movement, were analyzed.
Návaznosti
GV201/98/K041, projekt VaVNázev: HCILAB - Laboratoř interakcí člověka s počítačem
Investor: Grantová agentura ČR, HCILAB - Laboratoř interakcí člověka s počítačem
MSM 143100005, záměrNázev: Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
VytisknoutZobrazeno: 5. 5. 2024 17:22