PANTŮČEK, Roman, Petr PETRÁŠ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Roman RYBÁŘ and Jiří DOŠKAŘ. Variabilita genomu kmenů multirezistentního poddruhu Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus v České republice (Genomic variability of multiresistant subspecies Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus strains in the Czech Republic). In 22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms. Košice - Praha: Czechoslovak Society for Microbiology, 2001, p. 266. Abstract Book.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Variabilita genomu kmenů multirezistentního poddruhu Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus v České republice
Name (in English) Genomic variability of multiresistant subspecies Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus strains in the Czech Republic
Authors PANTŮČEK, Roman, Petr PETRÁŠ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Roman RYBÁŘ and Jiří DOŠKAŘ.
Edition Košice - Praha, 22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms, p. 266-266, Abstract Book, 2001.
Publisher Czechoslovak Society for Microbiology
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Slovakia
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/01:00005402
Organization unit Faculty of Science
Changed by Changed by: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Changed: 23/1/2002 10:55.
Abstract
Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus (SHN) je nový nedávno popsaný koaguláza-negativní poddruh [1], který bývá izolován z klinického materiálu hu-mánního původu, především z hemokultur. Kmeny jsou silně virulentní a všechny vykazují multirezistenci k antibiotikům. SHN je důležitým nosokomiálním agens [2], zatím je však přehlížený, jak u nás, tak i v zahraničních mikrobiologic-kých laboratořích. Do konce května 2001 bylo v České republice zachyceno 139 kmenů. Cílem práce bylo stanovit fenotypovou a genetickou variabilitu u 70 kmenů izolovaných v letech 1996-2000 celkem v 13 laboratořích klinické mikrobiologie v ČR. Identifikace kmenů byla provedena pomocí systémů STAPHYTest 16, API Staph a diskového testu na rezistenci k novobiocinu (disk 5 mg). Studované kmeny vykazovaly následující rezistence k antibiotikům stanovené diskovou metodou: oxacilin (98 % kmenů), erytromycin (91 %), klindamycin (95 %), ciprofloxacin (92 %), chloramfenikol (82 %), gentamicin (77 %), amoxicilin s klavulanovou kyselinou (77 %), tetracyklin (20 %), rifampicin (27 %), teikoplanin (3 %). Rezis-tence k oxacilinu byla potvrzena PCR-amplifikací mecA genu, při které byl získán pozitivní výsledek i u 2 citlivých kmenů. Při stanovení genetické variability kmenů byly testovány následující metody: analýza plazmidových profilů, PCR-ribotypizace, AP-PCR (s primery RW3A, BG2, EP017, ERIC1, ERIC2), amplifika-ce inzerčních elementů IS256 a makrorestrikční analýza. Nejpřesnějších výsledků bylo dosaženo pomocí makrorestrikční analýzy provedené pulzní gelovou elektro-forézou (PFGE), která umožnila jednoznačně odlišit kmeny SHN od druhého pod-druhu S. hominis subsp. hominis na hladině podobnosti 25%. Podobnost makrore-strikčních spekter genomové DNA se u SHN pohybovala v rozmezí 35-100 % s použitím restriktázy SmaI a 45-100% s KspI. U 70 studovaných kmenů bylo iden-tifikováno 32 makrorestrikčních profilů, které je možno rozdělit na základě sesta-veného dendrogramu do 14 klonálních typů. PFGE se jeví vzhledem k nejvyšší diskriminační schopnosti z použitých metod jako nejvhodnější metoda pro studium molekulární epidemiologie u SHN.
Abstract (in English)
in Czech
Links
GA301/99/D075, research and development projectName: Genotypová diagnostika a typizace klinicky významných koaguláza negativních stafylokoků
Investor: Czech Science Foundation, Genome-based diagnostics and typing of coagulase-negative staphylococci from human clinical specimens
MSM 143100008, plan (intention)Name: Genomy a jejich funkce
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Genomes and their functions
PrintDisplayed: 27/7/2024 18:40