3D Structure of the human genome: Order in randomness

KOZUBEK, Stanislav, Emilie LUKÁŠOVÁ, Pavla JIRSOVÁ, Irena KOUTNÁ, Michal KOZUBEK, Alena GAŇOVÁ, Eva BÁRTOVÁ, Martin FALK a Renata TASLEROVÁ. 3D Structure of the human genome: Order in randomness. Chromosoma. Berlin: Springer-Verlag, 2002, roč. 111, č. 5, s. 321-331. ISSN 0009-5915.

Základní údaje

Originální název

3D Structure of the human genome: Order in randomness

Autoři

KOZUBEK, Stanislav (203 Česká republika, domácí), Emilie LUKÁŠOVÁ (203 Česká republika), Pavla JIRSOVÁ (203 Česká republika), Irena KOUTNÁ (203 Česká republika, domácí), Michal KOZUBEK (203 Česká republika, garant, domácí), Alena GAŇOVÁ (203 Česká republika, domácí), Eva BÁRTOVÁ (203 Česká republika, domácí), Martin FALK (203 Česká republika) a Renata TASLEROVÁ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Chromosoma, Berlin, Springer-Verlag, 2002, 0009-5915

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Německo

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.829

Kód RIV

RIV/00216224:14330/02:00006554

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

UT WoS

000180569800005

Klíčová slova anglicky

human genome structure; interphase cell nuclei

Štítky

cbia-web, human genome structure, impacted journals+books, interphase cell nuclei

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

A complex study of the spatial arrangement of different genetic elements (genes, centromeres and chromosomal domains) in the cell nucleus is presented and the principles of this arrangement are discussed. We show that the radial location of genetic elements in the three-dimensional (3D) space between the center of the nucleus and the nuclear membrane is element specific and dependent on the position of the element on the chromosome. In contrast, mutual angular positioning of both homologous and heterologous genetic elements is, in the majority of cases, random. In several cases, tethering of heterologous genetic elements was observed. This close proximity of specific loci may be responsible for their mutual rearrangement and the development of cancer. Comparison of our results with transcriptome maps shows that the nuclear location of chromosomal domains with highly expressed genes is more central when compared with chromosomes with low expression. The higher-order chromatin structure is strikingly similar in various human cell types, which correlates with the fact that the profiles of gene expression are also similar.

---

Návaznosti

GA301/01/0186, projekt VaV	Název: Studium lokální kontroly exprese genů pomocí spektrální mikroskopie a analýzy obrazu Investor: Grantová agentura ČR, Studium lokální kontroly exprese genů pomocí spektrální mikroskopie a analýzy obrazu
IBS5004010, projekt VaV	Název: Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii Investor: Akademie věd ČR, Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
MSM 143300002, záměr	Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
NC5955, projekt VaV	Název: Jak může přispět studium prostorového uspořádání specifických genetických lokusů v jádře buněk zdravých a maligních tkání k diagnostice a léčbě solidních tumorů. Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Jak může přispět studium prostorového uspořádání specifických genetických lokusů v jádře buněk zdravých a maligních tkání k diagnostice a léčbě solidních tumorů