J 2002

The 3D structure of human chromosomes in cell nuclei

LUKÁŠOVÁ, Emilie; Stanislav KOZUBEK; Michal KOZUBEK; Martin FALK; Jana AMRICHOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

The 3D structure of human chromosomes in cell nuclei

Autoři

LUKÁŠOVÁ, Emilie (203 Česká republika); Stanislav KOZUBEK (203 Česká republika, domácí); Michal KOZUBEK (203 Česká republika, garant, domácí); Martin FALK (203 Česká republika) a Jana AMRICHOVÁ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Chromosome Research, Dordrecht, Kluwer Academic, 2002, 0967-3849

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Nizozemské království

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 1.828

Kód RIV

RIV/00216224:14330/02:00006557

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

UT WoS

000178954300002

Klíčová slova anglicky

chromosome structure; confocal microscopy; mathematical models; nuclear architecture

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 24. 8. 2012 12:24, doc. RNDr. Martin Falk, Ph.D.

Anotace

V originále

The spatial arrangement of some genetic elements relative to chromosome territories and in parallel with the cell nucleus was investigated in human lymphocytes. The structure of the chromosome territories was studied in chromosomes containing regions (clusters) of highly expressed genes (HSA 9, 17) and those without such clusters (HSA 8, 13). In chromosomes containing highly expressed regions, the elements pertaining to these regions were found close to the centre of the nucleus on the inner sides of chromosome territories; those pertaining to regions with low expression were localized close to the nuclear membrane on the opposite sides of the territories. In chromosomes with generally low expression (HSA 8, 13), the elements investigated were found symmetrically distributed over the territories. Based on the investigations of the chromosome structure, the following conclusions are suggested: (1) Chromosome territories have a non-random internal 3D structure with defined average mutual positions between elements. For example, RARalpha, TP53 and Iso-q of HSA 17 are nearer to each other than they are to the HSA 17 centromere. (2) The structure of a chromosome territory reflects the number and chromosome location of clusters of highly expressed genes. (3) Chromosome territories behave to some extent as solid bodies: if the territory is found closer to the nuclear centre, the individual genetic elements of this chromosome are also found, on average, closer the centre of the nucleus. (4) The positions of centromeres are, on average, nearer to the fluorescence weight centre of the territory (FWCT) than to genes. (5) Active genes are not found near the centromeres of their own territory. A simple model of the structure of chromosome territory is proposed.

Návaznosti

GA301/01/0186, projekt VaV
Název: Studium lokální kontroly exprese genů pomocí spektrální mikroskopie a analýzy obrazu
Investor: Grantová agentura ČR, Studium lokální kontroly exprese genů pomocí spektrální mikroskopie a analýzy obrazu
IAA1065203, projekt VaV
Název: Využití kombinace laserových mikrosvazkových a cytometrických technik ke studiu struktury a dynamiky lidského genomu
Investor: Akademie věd ČR, Využití kombinace laserových mikrosvazkových a cytometrických technik ke studiu struktury a dynamiky lidského genomu
IBS5004010, projekt VaV
Název: Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
Investor: Akademie věd ČR, Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
MSM 143300002, záměr
Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
NC5955, projekt VaV
Název: Jak může přispět studium prostorového uspořádání specifických genetických lokusů v jádře buněk zdravých a maligních tkání k diagnostice a léčbě solidních tumorů.
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Jak může přispět studium prostorového uspořádání specifických genetických lokusů v jádře buněk zdravých a maligních tkání k diagnostice a léčbě solidních tumorů