Další formáty:
BibTeX
LaTeX
RIS
@article{406336, author = {Oráčová, Eva and Kvardová, Veronika and Pantůček, Roman and Doškař, Jiří}, article_location = {Brno}, article_number = {1}, keywords = {Bacterial Typing Techniques; DNA; Bacteriophages; Staphylococcus aureus; Lysogeny; Multiplex PCR; Prophage detection}, language = {cze}, issn = {1210-6267}, journal = {Informační listy Genetické společnosti Gregora Mendela}, note = {Genetická konference - Perspektivy genetiky, genomy a genová exprese, Brno 5.-6. 2. 2002}, title = {Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aureus pomocí multiplex PCR}, volume = {24}, year = {2002} }
TY - JOUR ID - 406336 AU - Oráčová, Eva - Kvardová, Veronika - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří PY - 2002 TI - Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aureus pomocí multiplex PCR JF - Informační listy Genetické společnosti Gregora Mendela VL - 24 IS - 1 SP - 37 EP - 37 PB - Genetická společnost Gregora Mendela SN - 12106267 N1 - Genetická konference - Perspektivy genetiky, genomy a genová exprese, Brno 5.-6. 2. 2002 KW - Bacterial Typing Techniques KW - DNA KW - Bacteriophages KW - Staphylococcus aureus KW - Lysogeny KW - Multiplex PCR KW - Prophage detection N2 - V genomech typizačních fágů S. aureus mezinárodní řady byly vyhledány sekvence specific-ké pro fágové druhy séroskupin A (fág 3A, 5 003 bp), B (fág 53, 3 926 bp), F (fág 77, 3 398 bp) a L (fág 187, 1 927 bp). Hybridizační sondy připravené z těchto sekvencí detekují v lyzogenních kmenench S. aureus profágy příslušných fágových druhů. K usnadnění detekce profágů byly pro každou ze specifických sond stanoveny sekvence a navrženy PCR-primery, umožňující získat pro každý fágový druh amplifikační produkt charakteristické velikosti (pro fágy serologické skupiny A: 3A-F 5' CTT TGA CAT GAC ATC CGC TTG AC 3' a 3A-R 5' TAT CAG GCG AGA ATT AAG GG 3', produkt 745 bp; pro fágy serologické skupiny B: 53-F 5' ACT TAT CCA GGT GGY GTT ATT G 3' a 53-R 5' TGT ATT TAA TTT CGC CGT TAG TG 3', produkt 405 bp; pro fágy serologické skupiny F: 77-F 5' TAC GGG AAA ATA TTC GGA AG 3' a 77-R 5' ATA ATC CGC ACC TCA TTC CT 3', produkt 548 bp a pro fágy serologické skupiny L produkt 850 bp). Optimalizací sady primerů byla zavedena multiplex PCR pro přímý důkaz přítomnosti profágů jednotlivých druhů v jediné PCR-reakci. Metoda detekce profágů byla ověřena jak na uměle lyzogenizovaných kmenech připravených na našem pracovišti, tak na kmenech z klinického materiálu. S využitím této techniky byly prokázány významné rozdíly v obsahu profágů u meticilin-rezistentních kmenů. Srovnání diskriminační schopnosti několika genotypizačních metod (PFGE, ribotypizace) prokázalo, že stanovení rozdílů v obsahu profágů představuje velmi citlivou typizační metodu, která je vhodná i pro odlišení blízce příbuzných kmenů. ER -
ORÁČOVÁ, Eva, Veronika KVARDOVÁ, Roman PANTŮČEK a Jiří DOŠKAŘ. Detekce profágů v kmenech $<$I$>$Staphylococcus aureus$<$/I$>$ pomocí multiplex PCR. \textit{Informační listy Genetické společnosti Gregora Mendela}. Brno: Genetická společnost Gregora Mendela, 2002, roč.~24, č.~1, s.~37. ISSN~1210-6267.
|