J 2002

Program MULDER - A tool for extracting torsion angles from NMR data

PADRTA, Petr a Vladimír SKLENÁŘ

Základní údaje

Originální název

Program MULDER - A tool for extracting torsion angles from NMR data

Autoři

PADRTA, Petr (203 Česká republika) a Vladimír SKLENÁŘ (203 Česká republika, garant)

Vydání

Journal of Biomolecular NMR, Dordrecht, Kluwer/Escom, 2002, 0925-2738

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Nizozemské království

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.833

Kód RIV

RIV/00216224:14310/02:00007065

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000179810200006

Klíčová slova anglicky

computer graphics; interatomic distance; NMR; scalar coupling constant; software; torsion angle
Změněno: 20. 6. 2008 12:55, prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.

Anotace

V originále

MULDER (Mostly UniversaL Dihedral angle ExtractoR) is a program for extraction of torsion angle information from NMR data. Currently, it can analyze two types of input data: The torsion angle data, where several 3J-coupling constants and/or interatomic distances are combined in order to reduce the torsion angle ambiguity arising from solving the isolated Karplus (or distance) equation, and the sugar pucker data, where the dynamics of five-membered sugar rings is evaluated by postprocessing the results calculated from 3J(HH) coupling constants by program PSEUROT. Program MULDER can be used either as an alternative to r-MD programs in situations where only specific structural features are studied, or as a preparatory tool in connection with full r-MD structure calculation for extraction of unambiguous torsion angle restraints.

Návaznosti

LN00A016, projekt VaV
Název: BIOMOLEKULÁRNÍ CENTRUM
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum