Computer modelling of DNA quadruplex conformational behavior

FADRNÁ, Eva, Naděžda ŠPAČKOVÁ, Jiří ŠPONER a Jaroslav KOČA. Computer modelling of DNA quadruplex conformational behavior. In Chemické Listy. 2002. vyd. Praha: 54. Sjezd chemických společností, 2002, s. 425-426.

Základní údaje

Originální název

Computer modelling of DNA quadruplex conformational behavior

Autoři

FADRNÁ, Eva (203 Česká republika, garant), Naděžda ŠPAČKOVÁ (203 Česká republika), Jiří ŠPONER (203 Česká republika) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika)

Vydání

2002. vyd. Praha, Chemické Listy, od s. 425-426, 2 s. 2002

Nakladatel

54. Sjezd chemických společností

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10610 Biophysics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/02:00007241

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

structure; dynamics; nucleic acids

Štítky

dynamics, nucleic acids, structure

---

Anotace

V originále

Advanced methods of molecular modelling have been applied on the DNA quadruplexes. We have investigated an antiparallel DNA quadruplex formed by a dimerization of dGGGGTTTTGGGG with a four-tetrad stem and two lateral four-thymidine loop. A long scale molecular dynamics (MD) has been applied together with a post processing analysis including the study of solvation, interactions with ions, the free energy contribution and the entropy analysis.

---

Návaznosti

MSM 143100005, záměr

Název: Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu