2003
Dvourozměrná elektroforéza v proteomice: Principy a aplikace
BOUCHAL, Pavel and Igor KUČERABasic information
Original name
Dvourozměrná elektroforéza v proteomice: Principy a aplikace
Name (in English)
Two-dimensional Electrophoresis in Proteomics: Principles and Applications
Authors
BOUCHAL, Pavel (203 Czech Republic) and Igor KUČERA (203 Czech Republic, guarantor)
Edition
Chemické listy, Praha, Česká společnost chemická, 2003, 0009-2770
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Article in a journal
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
is not subject to a state or trade secret
References:
Impact factor
Impact factor: 0.345
RIV identification code
RIV/00216224:14310/03:00007948
Organization unit
Faculty of Science
UT WoS
000181006100005
Keywords in English
Proteom; Proteomika; Dvourozměrná elektroforéza; Hmotnostní spektrometrie; Analýza obrazu; Databáze
Tags
Changed: 4/6/2004 15:58, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
V originále
Proteomika, nové odvětví úzce související s genomikou, představuje komplexní analýzu proteinů buňky, tkáně či biologické tekutiny. Jádrem proteomiky je dvourozměrná elektroforéza, klíčová technologie při tvorbě proteinových map. Sestává ze speciálního postupu přípravy vzorku, isoelektrické fokusace, polyakrylamidové elektroforézy v přítomnosti dodecylsulfátu sodného a vizualizace gelu. Metodami analýzy obrazu jsou srovnávány a vyhodnocovány dvourozměrné separace komplexních směsí bílkovin v gelech a konstruovány proteinové mapy. Jednotlivé proteiny na proteinových mapách mohou být různými způsoby charakterizovány, nejčastěji hmotnostní spektrometrií, a na základě informací získaných o jejich struktuře identifikovány v databázích. Proteomické metody nacházejí smysluplné uplatnění při srovnávání komplexního proteinového složení v biologii, zvláště pak mikrobiologii a medicíně, kde mohou přispět k odhalení nových souvislostí mezi koncentrací proteinů a jejich fyziologickou funkcí.
In English
Proteomics, a new branch of science related to genomics, involves complex analysis of proteins of cells, tissues or biological fluids. Proteomics is today based on two-dimensional electrophoresis, the crucial technology in making protein maps. It consists of special procedure for preparation of sample, sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis and gel visualization. Two-dimensional separations of complex protein mixtures in gels are compared, evaluated by image analysis and protein maps are constructed. Individual proteins on the maps can be characterized by various methods, most frequently by mass spectrometry, and identified in databases using the information on their structure. Proteomic methods find useful applications in comparing complex protein composition in biology, especially in microbiology and medicine, where they can contribute to revealing new relations between concentrations of proteins and their physiologial functions.
Links
| GA203/01/1589, research and development project |
|