J 2003

Dvourozměrná elektroforéza v proteomice: Principy a aplikace

BOUCHAL, Pavel and Igor KUČERA

Basic information

Original name

Dvourozměrná elektroforéza v proteomice: Principy a aplikace

Name (in English)

Two-dimensional Electrophoresis in Proteomics: Principles and Applications

Authors

BOUCHAL, Pavel (203 Czech Republic) and Igor KUČERA (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Chemické listy, Praha, Česká společnost chemická, 2003, 0009-2770

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 0.345

RIV identification code

RIV/00216224:14310/03:00007948

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000181006100005

Keywords in English

Proteom; Proteomika; Dvourozměrná elektroforéza; Hmotnostní spektrometrie; Analýza obrazu; Databáze
Změněno: 4/6/2004 15:58, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Abstract

V originále

Proteomika, nové odvětví úzce související s genomikou, představuje komplexní analýzu proteinů buňky, tkáně či biologické tekutiny. Jádrem proteomiky je dvourozměrná elektroforéza, klíčová technologie při tvorbě proteinových map. Sestává ze speciálního postupu přípravy vzorku, isoelektrické fokusace, polyakrylamidové elektroforézy v přítomnosti dodecylsulfátu sodného a vizualizace gelu. Metodami analýzy obrazu jsou srovnávány a vyhodnocovány dvourozměrné separace komplexních směsí bílkovin v gelech a konstruovány proteinové mapy. Jednotlivé proteiny na proteinových mapách mohou být různými způsoby charakterizovány, nejčastěji hmotnostní spektrometrií, a na základě informací získaných o jejich struktuře identifikovány v databázích. Proteomické metody nacházejí smysluplné uplatnění při srovnávání komplexního proteinového složení v biologii, zvláště pak mikrobiologii a medicíně, kde mohou přispět k odhalení nových souvislostí mezi koncentrací proteinů a jejich fyziologickou funkcí.

In English

Proteomics, a new branch of science related to genomics, involves complex analysis of proteins of cells, tissues or biological fluids. Proteomics is today based on two-dimensional electrophoresis, the crucial technology in making protein maps. It consists of special procedure for preparation of sample, sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis and gel visualization. Two-dimensional separations of complex protein mixtures in gels are compared, evaluated by image analysis and protein maps are constructed. Individual proteins on the maps can be characterized by various methods, most frequently by mass spectrometry, and identified in databases using the information on their structure. Proteomic methods find useful applications in comparing complex protein composition in biology, especially in microbiology and medicine, where they can contribute to revealing new relations between concentrations of proteins and their physiologial functions.

Links

GA203/01/1589, research and development project
Name: Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí
Investor: Czech Science Foundation, Mechanisms involved in regulation of respiratory systems in denitrification bacteria by environmental factors