PRIMEX: rapid identification of oligonucleotide matches in whole genomes

LEXA, Matej a Giorgio VALLE. PRIMEX: rapid identification of oligonucleotide matches in whole genomes. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2003, roč. 19, č. 18, s. 2486-2488. ISSN 1367-4803.

Základní údaje

Originální název

PRIMEX: rapid identification of oligonucleotide matches in whole genomes

Autoři

LEXA, Matej a Giorgio VALLE

Vydání

Bioinformatics, Oxford, Oxford University Press, 2003, 1367-4803

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

20206 Computer hardware and architecture

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Primex server

Impakt faktor

Impact factor: 6.701

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

UT WoS

000187217700025

Klíčová slova anglicky

genomic; sequence; DNA; rapid search; inexact matches; mismatches; PCR primers

Štítky

DNA, genomic, inexact matches, mismatches, PCR primers, rapid search, SEQUENCE

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

PRIMEX can detect oligonucleotide sequences in whole genomes, allowing for mismatches. Using a word lookup table and server functionality, PRIMEX accepts queries from client software and returns matches rapidly. We find it faster and more sensitive than currently available tools.