J 2003

A Novel Mechanism of Proton Transfer in Protonated Peptides

KULHÁNEK, Petr; Edward W. SCHLAG a Jaroslav KOČA

Základní údaje

Originální název

A Novel Mechanism of Proton Transfer in Protonated Peptides

Autoři

KULHÁNEK, Petr (203 Česká republika); Edward W. SCHLAG (276 Německo) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika, garant)

Vydání

Journal of the American Chemical Society, Washington, DC., USA, American Chemical Society, 2003, 0002-7863

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10403 Physical chemistry

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 6.516

Kód RIV

RIV/00216224:14310/03:00009226

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000186424800028

Klíčová slova anglicky

proton transfer; proton exchange; proton interaction; DFT
Změněno: 13. 12. 2003 11:36, prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.

Anotace

V originále

The study presents quantum-chemical calculations on proton transfer in protonated N-acetylglycyl-N1-methylglycinamide (AGA) as a short oligopeptide model. All calculations employ the B3LYP functional and the 6-31++G** basis set. Two different mechanisms of proton transfer are discussed. The rate-determining step of the first mechanism exhibits an energy barrier of about 17.7 kcal/mol, and it is represented by an isomerization of the proton around the double bond of the carbonyl group. The second mechanism is based on the large conformational flexibility of AGA, where all carbonyl oxygens cooperate. The rate-determining step of this mechanism exhibits an energy barrier of only 8.3 kcal/mol.

Návaznosti

LN00A016, projekt VaV
Název: BIOMOLEKULÁRNÍ CENTRUM
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum