2004
Topography of genetic loci in the nuclei of cells of colorectal carcinoma and adjacent tissue of colonic epithelium
LUKÁŠOVÁ, Emilie, Stanislav KOZUBEK, Martin FALK, Michal KOZUBEK, Jan ŽALOUDÍK et. al.Základní údaje
Originální název
Topography of genetic loci in the nuclei of cells of colorectal carcinoma and adjacent tissue of colonic epithelium
Název česky
Topografie genetických lokusů v jádrech buněk kolorektálního karcionomu a přiléhající tkáně střevního epitelu
Autoři
LUKÁŠOVÁ, Emilie (203 Česká republika), Stanislav KOZUBEK (203 Česká republika), Martin FALK (203 Česká republika), Michal KOZUBEK (203 Česká republika, garant, domácí), Jan ŽALOUDÍK (203 Česká republika, domácí), Václav VAGUNDA (203 Česká republika) a Zdeněk PAVLOVSKÝ (203 Česká republika, domácí)
Vydání
Chromosoma, Berlin, Springer-Verlag, 2004, 0009-5915
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
30200 3.2 Clinical medicine
Stát vydavatele
Německo
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 2.714
Kód RIV
RIV/00216224:14330/04:00009648
Organizační jednotka
Fakulta informatiky
UT WoS
000189275900002
Klíčová slova anglicky
chromatin structure; colorectal carcinoma
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 24. 8. 2012 13:28, doc. RNDr. Martin Falk, Ph.D.
V originále
To determine the influence of increased gene expression and amplification in colorectal carcinoma on chromatin structure, the nuclear distances between pairs of bacterial artificial chromosome (BAC) clones with genomic separation from 800 to 29,000 kb were measured and compared between the tumor and parallel epithelial cells of six patients. The nuclear distances were measured between the loci in chromosomal bands 7p22.3-7p21.3; 7q35-7q36.3; 11p15.5-11p15.4; 20p13; 20p12.2; 20q11.21 and 20q12 where increased expression had been found in all types of colorectal carcinoma. The loci were visualized by three-dimensional fluorescence in situ hybridization using 22 BAC clones. Our results show that for short genomic separations, mean nuclear distance increases linearly with increased genomic separation. The results for some pairs of loci fell outside this linear slope, indicating the existence of different levels of chromatin folding. For the same genomic separations the nuclear distances were frequently shorter for tumor as compared with epithelial cells. Above the initial growing phase of the nuclear distances, a plateau phase was observed in both cell types where the increase in genomic separation was not accompanied by an increase in nuclear distance. The ratio of the mean nuclear distances between the corresponding loci in tumor and epithelium cells decreases with increasing amplification of loci. Our results further show that the large-scale chromatin folding might differ for specific regions of chromosomes and that it is basically preserved in tumor cells in spite of the amplification of many loci.
Česky
Článek pojednává o topografii genetických lokusů v jádrech buněk kolorektálního karcionomu a přiléhající tkáně střevního epitelu
Návaznosti
| GA202/02/0804, projekt VaV |
| ||
| IAA1065203, projekt VaV |
| ||
| IAA5004306, projekt VaV |
| ||
| NC6987, projekt VaV |
|