SVOBODA, David. Towards a Fully Automated Tissue Cell Segmentation Method. In Visualization, Imaging, and Image Processing. Anaheim, Calgary, Zurich: ACTA Press, 2004, s. 430-434. ISBN 0-88986-454-3.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Towards a Fully Automated Tissue Cell Segmentation Method
Název česky Směrem k plně automatizované metodě segmentace tkání
Autoři SVOBODA, David (203 Česká republika, garant).
Vydání Anaheim, Calgary, Zurich, Visualization, Imaging, and Image Processing, od s. 430-434, 5 s. 2004.
Nakladatel ACTA Press
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Španělsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14330/04:00010272
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 0-88986-454-3
UT WoS 000228556600075
Klíčová slova anglicky Biomedical image segmentation; Adaptive thresholding; Gradient based thresholding; Region labeling
Štítky Adaptive thresholding, Biomedical image segmentation, Gradient based thresholding, Region labeling
Změnil Změnil: doc. RNDr. David Svoboda, Ph.D., učo 2824. Změněno: 22. 1. 2008 08:16.
Anotace
In this paper, an automatic method for tissue cell localization is proposed. It is based on the principle of adaptive thresholding. While the general adaptive thresholding method requires setting of some parameters by user, a novel algorithm chooses suitable thresholds and image division on its own. The resulting binary image is then submitted to a region labeling procedure. Each individual region is inspected and tested for suitability for further processing. Finally, each region is marked by one marker. Feasibility of this approach has already been successfully tested on 3D colon tissue images.
Anotace česky
V tomto článku je navržena plně automatizovaná metoda sloužící k lokalizaci buněk ve snímcích tkání. Metoda je založena na principu adaptivního prahování. Zatímco obecná metoda adaptivního prahování vyžaduje ke svému spuštění určitý počet vstupů, nová metoda je schopna tyto si parametry vhodně nastavit sama. Po odprahování výsledný binární obraz podléhá algoritmu "region labeling". Následně je každá nalezená buňka v obraze prověřena a otestována, zda je vůbec vhodná pro zařazení k dalším výpočtům. Na závěr je každá buňka opatřena značkou, která identifikuje polohu této buňky v rámci celého snímku tkáně. Vhodnost této metody již byla úspěšně prověřena na 3D snímcích tkání tlustého střeva.
Návaznosti
IAA5004306, projekt VaVNázev: Struktura lidského genomu
Investor: Akademie věd ČR, Struktura lidského genomu
IBS5004010, projekt VaVNázev: Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
Investor: Akademie věd ČR, Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
MSM 143300002, záměrNázev: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
VytisknoutZobrazeno: 27. 4. 2024 10:57