Ribotypizace a fenotypová charakteristika kmenů rodu
Xenorhabdus

D 2004

Ribotypizace a fenotypová charakteristika kmenů rodu Xenorhabdus

SEDLÁČEK, Ivo, Pavel HYRŠL a Zdenka PÁČOVÁ

Základní údaje

Originální název

Ribotypizace a fenotypová charakteristika kmenů rodu Xenorhabdus

Autoři

SEDLÁČEK, Ivo, Pavel HYRŠL a Zdenka PÁČOVÁ

Vydání

Praha - Bratislava, 23. kongres Československé společnosti mikrobiologické, příloha Bulletinu Československé společnosti mikrobiologické, č.45, s. 263-263, 2004

Nakladatel

Československá společnost mikrobiologická

Další údaje

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

0009-0646

Klíčová slova anglicky

Xenorhabdus; ribotypizace

Štítky

ribotypizace, Xenorhabdus

Změněno: 20. 3. 2006 15:16, doc. RNDr. Pavel Hyršl, Ph.D.

Anotace

V originále

Z entomopatogenní hlístovky Steinernema feltiae (kmen Prosenice) byly izolovány dvě gramnegativní fermentující tyčky, deponované v České sbírce mikroorganismů PřF MU pod čísly CCM 7003 a CCM 7004. Na základě fenotypových charakteristik (komerční identifikační sety, konvenční testy) byly oba izoláty zařazeny do rodu Xenorhabdus. Protože se jednalo o první záchyt xenorhabdů z České republiky, byly tyto izoláty podrobně studovány ribotypizací a fenotypizací a srovnány s typovými kulturami všech druhů rodu Xenorhabdus (X. beddingii, X. bovienii, X. japonica, X. nematophila a X. poinarii). Pro studium biotypizace byly použity komerční identifikační sety (ENTEROtest 24, API 20E, API 20 NE, API 50CH) spolu s dodatkovými růstovými testy. Srovnání proteinového spektra testovaných bakteriálních kultur bylo provedeno metodou SDS-PAGE. Podařilo se prokázat více než 40 proteinových frakcí v rozmezí 6,5 200 kDa se signifikantními rozdíly mezi jednotlivými druhy. Na základě fenotypových charakteristik a proteinových spekter byly izoláty CCM 7003 a CCM 7004 identifikovány jako X. bovienii. Ribotypizací pomocí restrikčních enzymů EcoRI a HindIII a sondou komplementární k 16S a 23S rRNA izolované z E. coli, byly studované kmeny xenorhabdů rozděleny do druhově odlišných ribotypů (program GelCompar II) s výjimkou kmenů CCM 7003 a CCM 7004. Shodný ribotyp těchto dvou kultur prokázal, že se jedná o dva izoláty jednoho kmene. Dendrogram ribotypů studovaných xenorhabdů se shodoval s fenotypovou klasifikací a potvrdil fylogenetickou příbuznost izolátů s druhem X. bovienii při použití obou restrikčních enzymů. Ribotypizace tak může být vhodnou metodou při klasifikaci obtížně kultivovatelných či málo známých taxonů prokaryot.

Citovat

SEDLÁČEK, Ivo, Pavel HYRŠL a Zdenka PÁČOVÁ. Ribotypizace a fenotypová charakteristika kmenů rodu Xenorhabdus. In 23. kongres Československé společnosti mikrobiologické, příloha Bulletinu Československé společnosti mikrobiologické, č.45. Praha - Bratislava: Československá společnost mikrobiologická, 2004, s. 263. ISBN 0009-0646.

@inproceedings{557871,
   author = {Sedláček, Ivo and Hyršl, Pavel and Páčová, Zdenka},
   address = {Praha - Bratislava},
   booktitle = {23. kongres Československé společnosti mikrobiologické, příloha Bulletinu Československé společnosti mikrobiologické, č.45},
   keywords = {Xenorhabdus; ribotypizace},
   location = {Praha - Bratislava},
   isbn = {0009-0646},
   pages = {263-263},
   publisher = {Československá společnost mikrobiologická},
   title = {Ribotypizace a fenotypová charakteristika kmenů rodu Xenorhabdus},
   year = {2004}
}

TY  - JOUR
ID  - 557871
AU  - Sedláček, Ivo - Hyršl, Pavel - Páčová, Zdenka
PY  - 2004
TI  - Ribotypizace a fenotypová charakteristika kmenů rodu Xenorhabdus
PB  - Československá společnost mikrobiologická
CY  - Praha - Bratislava
SN  - 00090646
KW  - Xenorhabdus
KW  - ribotypizace
N2  - Z entomopatogenní hlístovky Steinernema feltiae (kmen Prosenice) byly izolovány dvě gramnegativní fermentující tyčky, deponované v České sbírce mikroorganismů PřF MU pod čísly CCM 7003 a CCM 7004. Na základě fenotypových charakteristik (komerční identifikační sety, konvenční testy) byly oba izoláty zařazeny do rodu Xenorhabdus. Protože se jednalo o první záchyt xenorhabdů z České republiky, byly tyto izoláty podrobně studovány ribotypizací a fenotypizací a srovnány s typovými kulturami všech druhů rodu Xenorhabdus (X. beddingii, X. bovienii, X. japonica, X. nematophila a X. poinarii). Pro studium biotypizace byly použity komerční identifikační sety (ENTEROtest 24, API 20E, API 20 NE, API 50CH) spolu s dodatkovými růstovými testy. Srovnání proteinového spektra testovaných bakteriálních kultur bylo provedeno metodou SDS-PAGE. Podařilo se prokázat více než 40 proteinových frakcí v rozmezí 6,5 200 kDa se signifikantními rozdíly mezi jednotlivými druhy. Na základě fenotypových charakteristik a proteinových spekter byly izoláty CCM 7003 a CCM 7004 identifikovány jako X. bovienii. Ribotypizací pomocí restrikčních enzymů EcoRI a HindIII a sondou komplementární k 16S a 23S rRNA izolované z E. coli, byly studované kmeny xenorhabdů rozděleny do druhově odlišných ribotypů (program GelCompar II) s výjimkou kmenů CCM 7003 a CCM 7004. Shodný ribotyp těchto dvou kultur prokázal, že se jedná o dva izoláty jednoho kmene. Dendrogram ribotypů studovaných xenorhabdů se shodoval s fenotypovou klasifikací a potvrdil fylogenetickou příbuznost izolátů s druhem X. bovienii při použití obou restrikčních enzymů. Ribotypizace tak může být vhodnou metodou při klasifikaci obtížně kultivovatelných či málo známých taxonů prokaryot.
ER  -

SEDLÁČEK, Ivo, Pavel HYRŠL a Zdenka PÁČOVÁ. Ribotypizace a fenotypová charakteristika kmenů rodu Xenorhabdus. In \textit{23. kongres Československé společnosti mikrobiologické, příloha Bulletinu Československé společnosti mikrobiologické, č.45}. Praha - Bratislava: Československá společnost mikrobiologická, 2004, s.~263. ISBN~0009-0646.

Podrobný výpis o publikaci