D 2004

High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis

MATULA, Pavel, Petr MATULA, Michal KOZUBEK and Petr MEJZLÍK

Basic information

Original name

High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis

Name in Czech

Projekt Síťové cytometrie s vysokým rozlišením: Klient/server system pro 3D optickou mikroskopii

Authors

MATULA, Pavel (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Petr MATULA (203 Czech Republic, belonging to the institution), Michal KOZUBEK (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Petr MEJZLÍK (203 Czech Republic)

Edition

Los Alamitos, 2nd International Symposium on 3D Data Processing, Visualization, and Transmission, p. 580-583, 4 pp. 2004

Publisher

IEEE Computer Society

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Country of publisher

United States of America

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Publication form

printed version "print"

RIV identification code

RIV/00216224:14330/04:00010341

Organization unit

Faculty of Informatics

ISBN

0-7695-2223-8

UT WoS

000224459000076

Keywords in English

3d image processing; high-resolution cytometry

Tags

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 12/2/2018 15:06, doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D.

Abstract

ORIG CZ

V originále

If several laboratories work in the same field and need to cooperate, it is necessary to exchange and mutually compare their computer results. The quick way to solve this problem is to unite their file formats (if it is practicable) or to install new software systems, which are data or file format compatible. A much better solution is to use only one common system. This article describes the architecture of a new client-server system, which offers possibilities of effective cooperation for laboratories doing the research in the field of the spatial organization of human genome. However, the system design is determined mainly by optical microscopy principles and therefore the system can easily be modified for use in other applications or environments. The most pressing problem during the system design was how to share and process large 3D image data in client-server architecture.

In Czech

Pokud pracuje několik laboratoří ve stejném oboru a potřebují spolupracovat, tak si musí nezbytně vyměňovat a vzájemně srovnávat své počítačové výsledky. Rychlý způsob jak vyřešit tento problém je sjednotit souborové formáty nebo nainstalovat takové softwarové systémy, které jsou datově kompatibilní. Lepším řešením je samozřejmě používat pouze jeden společný systém. Článek popisuje architekturu nového klient-server systému, který nabízí možnost efektivní spolupráce laboratoří pracujících na výzkumu v oblasti studia prostorového uspořádání lidského genomu. Návrh systému je však určen především principy optické mikroskopie a je ho proto možné snadno upravit i pro jiné aplikace a prostředí. Nejpalčivějším problémem při návrhu systému bylo jak sdílet a zpracovávat objemná 3D obrazová data v klient-server architektuře.

Links

GP204/03/D034, research and development project
Name: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
Investor: Czech Science Foundation, Threedimensional analysis of cell nuclei using image cytometry
MSM 143300002, plan (intention)
Name: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Application of computer image analysis in optical microscopy