FIALA, Radovan, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases. In 19th NMR Valtice. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2004, s. 33. ISBN 80-210-3352-5.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases
Název česky NMR experimenty pro korelaci kvarterních uhlíků v bazích RNA
Autoři FIALA, Radovan (203 Česká republika, garant), Markéta MUNZAROVÁ (203 Česká republika) a Vladimír SKLENÁŘ (203 Česká republika).
Vydání 1. vyd. Brno, 19th NMR Valtice, s. 33-33, 2004.
Nakladatel Masarykova univerzita
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14310/04:00010705
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 80-210-3352-5
UT WoS 000222502200002
Klíčová slova anglicky NMR; spin-spin coupling; RNA; nucleic acid; quaternary carbon
Štítky NMR, nucleic acid, quaternary carbon, RNA, spin-spin coupling
Změnil Změnil: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564. Změněno: 17. 1. 2005 12:16.
Anotace
A set of triple-resonance two-dimensional NMR experiments is presented that can be used for correlating all quaternary carbons in RNA bases to one or more of the base protons. The experiments make use of either three-bond proton-carbon couplings and one selective INEPT step (long-range selective HSQC experiment) to transfer the magnetization between a proton and the carbon of interest and back, or they rely on one- and/or two-bond heteronuclear (the H(CN)C and H(N)C experiments) or carbon-carbon couplings (the H(C)C experiment) and multiple INEPT transfer steps. The effect of the large one-bond carbon-carbon coupling in t1 is removed by a constant time evolution or by a selective refocusing. The sensitivity of all the experiments proposed is high enough to obtain a spectrum of 0.5 mM 25-mer RNA stem-loop in four hours or less on a 600 MHz (1H) spectrometer. The results show that the experiments are also applicable to samples containing agents for weak molecular alignment.
Anotace česky
Práce představuje nové heteronukleární 2D NMR experimenty pro korelaci všech kvarterních uhlíků v bázích RNA s jedním nebo více jádry vodíku. Experimenty jsou založeny na jedno, dvou nebo třívazebných interakcích a několikanásobných přenosech magnetizace. Štěpení signálu vlivem jednovazebné interakce uhlík-uhlík je odstraněno pomozí vývoje v konstantním čase nebo selektivní refokusací. Citrlivost navrhovaných experimentů dovoluje naměřit spektra 0.5 mM 25-meru RNA za čtyři hodiny nebo méně. Experimenty jsou aplikovatelné i na vzorky v orietovaných fázích.
Návaznosti
LN00A016, projekt VaVNázev: BIOMOLEKULÁRNÍ CENTRUM
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
VytisknoutZobrazeno: 9. 5. 2024 15:21