2004
Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases
FIALA, Radovan, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘZákladní údaje
Originální název
Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases
Název česky
NMR experimenty pro korelaci kvarterních uhlíků v bazích RNA
Autoři
FIALA, Radovan (203 Česká republika, garant), Markéta MUNZAROVÁ (203 Česká republika) a Vladimír SKLENÁŘ (203 Česká republika)
Vydání
1. vyd. Brno, 19th NMR Valtice, s. 33-33, 2004
Nakladatel
Masarykova univerzita
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Kód RIV
RIV/00216224:14310/04:00010705
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISBN
80-210-3352-5
UT WoS
000222502200002
Klíčová slova anglicky
NMR; spin-spin coupling; RNA; nucleic acid; quaternary carbon
Štítky
Změněno: 17. 1. 2005 12:16, doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
V originále
A set of triple-resonance two-dimensional NMR experiments is presented that can be used for correlating all quaternary carbons in RNA bases to one or more of the base protons. The experiments make use of either three-bond proton-carbon couplings and one selective INEPT step (long-range selective HSQC experiment) to transfer the magnetization between a proton and the carbon of interest and back, or they rely on one- and/or two-bond heteronuclear (the H(CN)C and H(N)C experiments) or carbon-carbon couplings (the H(C)C experiment) and multiple INEPT transfer steps. The effect of the large one-bond carbon-carbon coupling in t1 is removed by a constant time evolution or by a selective refocusing. The sensitivity of all the experiments proposed is high enough to obtain a spectrum of 0.5 mM 25-mer RNA stem-loop in four hours or less on a 600 MHz (1H) spectrometer. The results show that the experiments are also applicable to samples containing agents for weak molecular alignment.
Česky
Práce představuje nové heteronukleární 2D NMR experimenty pro korelaci všech kvarterních uhlíků v bázích RNA s jedním nebo více jádry vodíku. Experimenty jsou založeny na jedno, dvou nebo třívazebných interakcích a několikanásobných přenosech magnetizace. Štěpení signálu vlivem jednovazebné interakce uhlík-uhlík je odstraněno pomozí vývoje v konstantním čase nebo selektivní refokusací. Citrlivost navrhovaných experimentů dovoluje naměřit spektra 0.5 mM 25-meru RNA za čtyři hodiny nebo méně. Experimenty jsou aplikovatelné i na vzorky v orietovaných fázích.
Návaznosti
| LN00A016, projekt VaV |
|