Další formáty:
BibTeX
LaTeX
RIS
@article{566696, author = {Eyer, Luděk and Pantůček, Roman and Růžičková, Vladislava and Kašpárek, Petr and Konečná, Hana and Zdráhal, Zbyněk and Preisler, Jan and Doškař, Jiří}, article_location = {Brno}, article_number = {1}, keywords = {bacteriophage; phage therapy; MALDI-TOF; proteomics; genome}, language = {cze}, issn = {1210-6267}, journal = {Informační listy Česko-Slovenské genetické společnosti Gregora Mendela.}, title = {Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812}, volume = {28}, year = {2005} }
TY - JOUR ID - 566696 AU - Eyer, Luděk - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava - Kašpárek, Petr - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk - Preisler, Jan - Doškař, Jiří PY - 2005 TI - Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812 JF - Informační listy Česko-Slovenské genetické společnosti Gregora Mendela. VL - 28 IS - 1 SP - 7 EP - 7 PB - Brno MU Přírodovědecká fakulta. SN - 12106267 KW - bacteriophage KW - phage therapy KW - MALDI-TOF KW - proteomics KW - genome N2 - Bakteriofág 812, zástupce čeledi Myoviridae, je virulentní polyvalentní fág s širokým rozmezím hostitelů, zahrnujícím kmeny a druhy rodu Staphylococcus. Tyto vlastnosti jej činí vhodným kandidátem pro fágovou terapii stafylokokových infekcí. Tato práce byla zaměřena na srovnání genomu a proteomu standardního typu fága 812, jeho mutant v rozmezí hostitele a příbuzných fágů U16, SK311, 131 a Twort s cílem objastnit molekulární základ jejich rozdílného hostitelského rozmezí. Genomy uvedených fágů tvořené lineární dvouřetězcovou DNA o velikosti 145 kb byly srovnávány pomocí restrikční analýzy. Úseky vykazující u jednotlivých fágů rozdíly byly pak charakterizovány detailně. Pro účely proteomických studií byla použita 1-D SDS-PAGE. Nalezené proteiny byly identifikovány metodou peptidového mapování s využitím MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie. Srovnáním fágových genomů byly zjištěny vedle nukleotidových substitucí též rozsáhlejší přestavby sekvencí DNA. Inzerce a delece o velikosti ~1 až 3 kb byly nalezeny převážně v nekódujících terminálních sekvencích DNA fágů s odlišným rozmezím hostitele. Nalezené změny v genomové DNA byly korelovány s proteinovým složením fágů. Použitím 1-D SDS-PAGE bylo nalezeno více než 20 strukturních proteinů o velikosti cca 15-120 kDa. Metodou peptidového mapování bylo identifikováno 7 proteinů. Dva z nich byly určeny jako hlavní kapsidový protein (51,2 kDa) a protein bičíkové pochvy (64,4 kDa), funkce ostatních identifikovaných proteinů není dosud známa. Všechny tyto proteiny vykazují vysokou sekvenční shodu s odpovídajícími proteiny polyvalentních stafylokokových fágů Twort a K a také s fágy A511 Listeria monocytogenes a LP65 Lactobacillus plantarum. Pomocí SDS-PAGE byly prokázány rozdíly v molekulové hmotnosti proteinů bičíkové pochvy fágů 812, SK311 a U16. Strukturní změny proteinů bičíkové pochvy by mohly být odpovědné za rozdílné hostitelské rozmezí polyvalentních bakteriofágů. ER -
EYER, Luděk, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Petr KAŠPÁREK, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Jan PREISLER a Jiří DOŠKAŘ. Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812. \textit{Informační listy Česko-Slovenské genetické společnosti Gregora Mendela.}. Brno: Brno MU Přírodovědecká fakulta., 2005, roč.~28, č.~1, s.~7. ISSN~1210-6267.
|