Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@article{566696,
author = {Eyer, Luděk and Pantůček, Roman and Růžičková, Vladislava and Kašpárek, Petr and Konečná, Hana and Zdráhal, Zbyněk and Preisler, Jan and Doškař, Jiří},
article_location = {Brno},
article_number = {1},
keywords = {bacteriophage; phage therapy; MALDI-TOF; proteomics; genome},
language = {cze},
issn = {1210-6267},
journal = {Informační listy Česko-Slovenské genetické společnosti Gregora Mendela.},
title = {Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812},
volume = {28},
year = {2005}
}
TY - JOUR
ID - 566696
AU - Eyer, Luděk - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava - Kašpárek, Petr - Konečná, Hana - Zdráhal, Zbyněk - Preisler, Jan - Doškař, Jiří
PY - 2005
TI - Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812
JF - Informační listy Česko-Slovenské genetické společnosti Gregora Mendela.
VL - 28
IS - 1
SP - 7
EP - 7
PB - Brno MU Přírodovědecká fakulta.
SN - 12106267
KW - bacteriophage
KW - phage therapy
KW - MALDI-TOF
KW - proteomics
KW - genome
N2 - Bakteriofág 812, zástupce čeledi Myoviridae, je virulentní polyvalentní fág s širokým rozmezím hostitelů, zahrnujícím kmeny a druhy rodu Staphylococcus. Tyto vlastnosti jej činí vhodným kandidátem pro fágovou terapii stafylokokových infekcí. Tato práce byla zaměřena na srovnání genomu a proteomu standardního typu fága 812, jeho mutant v rozmezí hostitele a příbuzných fágů U16, SK311, 131 a Twort s cílem objastnit molekulární základ jejich rozdílného hostitelského rozmezí. Genomy uvedených fágů tvořené lineární dvouřetězcovou DNA o velikosti 145 kb byly srovnávány pomocí restrikční analýzy. Úseky vykazující u jednotlivých fágů rozdíly byly pak charakterizovány detailně. Pro účely proteomických studií byla použita 1-D SDS-PAGE. Nalezené proteiny byly identifikovány metodou peptidového mapování s využitím MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie. Srovnáním fágových genomů byly zjištěny vedle nukleotidových substitucí též rozsáhlejší přestavby sekvencí DNA. Inzerce a delece o velikosti ~1 až 3 kb byly nalezeny převážně v nekódujících terminálních sekvencích DNA fágů s odlišným rozmezím hostitele. Nalezené změny v genomové DNA byly korelovány s proteinovým složením fágů. Použitím 1-D SDS-PAGE bylo nalezeno více než 20 strukturních proteinů o velikosti cca 15-120 kDa. Metodou peptidového mapování bylo identifikováno 7 proteinů. Dva z nich byly určeny jako hlavní kapsidový protein (51,2 kDa) a protein bičíkové pochvy (64,4 kDa), funkce ostatních identifikovaných proteinů není dosud známa. Všechny tyto proteiny vykazují vysokou sekvenční shodu s odpovídajícími proteiny polyvalentních stafylokokových fágů Twort a K a také s fágy A511 Listeria monocytogenes a LP65 Lactobacillus plantarum. Pomocí SDS-PAGE byly prokázány rozdíly v molekulové hmotnosti proteinů bičíkové pochvy fágů 812, SK311 a U16. Strukturní změny proteinů bičíkové pochvy by mohly být odpovědné za rozdílné hostitelské rozmezí polyvalentních bakteriofágů.
ER -
EYER, Luděk, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Petr KAŠPÁREK, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Jan PREISLER and Jiří DOŠKAŘ. Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812 (Genomic and proteomic characterization of polyvalent staphylococcal bacteriophage 812). \textit{Informační listy Česko-Slovenské genetické společnosti Gregora Mendela.}. Brno: Brno MU Přírodovědecká fakulta., 2005, vol.~28, No~1, p.~7. ISSN~1210-6267.
|
