Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity
proteins

D 2004

Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins

ŠMAJS, David a Magda JANALÍKOVÁ

Základní údaje

Originální název

Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins

Název česky

Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny

Název anglicky

Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins

Autoři

ŠMAJS, David (203 Česká republika, garant) a Magda JANALÍKOVÁ (203 Česká republika)

Vydání

Brno, VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004. od s. 11-12, 2 s. 2004

Nakladatel

Masarykova univerzita v Brně

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14110/04:00012096

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

80-210-3321-5

Klíčová slova anglicky

colicin; immunity protein

Štítky

colicin, immunity protein

Změněno: 30. 5. 2005 14:05, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y nejsou producenti kolicinů U a Y zkříženě imunní. Pro studium protein-proteinových interakcí mezi kolicinem a jeho imunitním proteinem jsme zkonstruovali sedm hybridních genů pro kolicin U/Y. Plazmidy nesoucí tyto geny byly transformovány do E. coli a z těchto buněk byly následně izolovány hybridní koliciny. Zkoumali jsme jejich letální účinek na buňky transformované plazmidem nesoucí gen pro imunitní protein kolicinu U a kolicinu Y. Buňky bez imunitního proteinu sloužily jako kontrola. Zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa kolicinového genu (v 34 aminokyselinách na C-konci - z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách.

Anglicky

Interaction of colicins with their cognate immunity proteins has been studied. Amino acid residues V590 a Y586 were found to be important for interaction of colicin Y with its cognate immunity protein and G580 and F576 in the colicin U molecule.

Návaznosti

GA310/03/1091, projekt VaV

Název: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Investor: Grantová agentura ČR, Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Citovat

ŠMAJS, David a Magda JANALÍKOVÁ. Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins. In VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, s. 11-12. ISBN 80-210-3321-5.

@inproceedings{571689,
   author = {Šmajs, David and Janalíková, Magda},
   address = {Brno},
   booktitle = {VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004.},
   keywords = {colicin; immunity protein},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {80-210-3321-5},
   pages = {11-12},
   publisher = {Masarykova univerzita v Brně},
   title = {Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins},
   year = {2004}
}

TY  - JOUR
ID  - 571689
AU  - Šmajs, David - Janalíková, Magda
PY  - 2004
TI  - Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins
PB  - Masarykova univerzita v Brně
CY  - Brno
SN  - 8021033215
KW  - colicin
KW  - immunity protein
N2  - Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y nejsou producenti kolicinů U a Y zkříženě imunní. Pro studium protein-proteinových interakcí mezi kolicinem a jeho imunitním proteinem jsme zkonstruovali sedm hybridních genů pro kolicin U/Y. Plazmidy nesoucí tyto geny byly transformovány do E. coli a z těchto buněk byly následně izolovány hybridní koliciny. Zkoumali jsme jejich letální účinek na buňky transformované plazmidem nesoucí gen pro imunitní protein kolicinu U a kolicinu Y. Buňky bez imunitního proteinu sloužily jako kontrola. Zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa kolicinového genu (v 34 aminokyselinách na C-konci - z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách.
ER  -

ŠMAJS, David a Magda JANALÍKOVÁ. Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins. In \textit{VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004.}. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, s.~11-12. ISBN~80-210-3321-5.

Podrobný výpis o publikaci