Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity
proteins

D 2004

Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins

ŠMAJS, David and Petra MATĚJKOVÁ

Basic information

Original name

Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins

Name in Czech

Interakce kolicinů U a Y s rekombinantními imunitními proteiny

Name (in English)

Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins

Authors

ŠMAJS, David (203 Czech Republic, guarantor) and Petra MATĚJKOVÁ (203 Czech Republic)

Edition

Brno, VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. p. 17-17, 2004

Publisher

Masarykova univerzita v Brně

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14110/04:00012098

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

80-210-3321-5

Keywords in English

colicin; immunity protein

Abstract

ORIG EN

V originále

Pro identifikaci aminokyselinových zbytků imunitního proteinu kolicinu U a Y interagujících s kolicinem U a Y byly použity dvě základní techniky. První z nich spočívala v konstrukci hybridních proteinů mezi imunitními proteiny kolicinů U a Y a druhý přístup spočíval v cílené mutagenezi genu pro imunitní protein kolicinu U tak, aby změny v aminokyselinové sekvenci odpovídaly sekvenci imunitního proteinu kolicinu Y. Bylo připraveno 16 odlišných hybridních genů pro imunitní protein a 29 konstruktů zahrnujících záměnu 44 odlišných aminokyselinových zbytků (z celkového počtu 54 odlišných). U těchto konstruktů byla testována imunita ke kolicinům U, Y, A, B a N. Imunitní protein kolicinu U je zcela specifický pro kolicin U a nepřináší imunitu proti žádnému jinému testovanému kolicinu. Oproti tomu imunitní protein kolicinu Y přináší jak specifickou imunitu proti kolicinu Y (i když ne tak výraznou jako imunitní protein kolicinu U ke kolicinu U), tak částečnou imunitu ke kolicinu U a A (nikoliv však k sekvenčně příbuzným kolicinům B a N). Aminokyseliny významné pro imunitu ke kolicinu U jsou lokalizovány mezi zbytky 13 - 19 imunitního proteinu. Tyto aminokyseliny jsou lokalizovány v 1. transmembránovém úseku imunitního proteinu. Další interakční místo se předpokládá ve druhém a čtvrtém transmembránovém úseku. U imunitního proteinu kolicinu Y je pravděpodobné, že interakční místo s kolicinem Y tvoří aminokyselinové zbytky druhého a čtvrtého transmembránového úseku, které navzájem spolupracují a kódují imunitu ke kolicinu Y jen tehdy, jsou-li přítomny současně.

In English

Interaction sotes in colicin U and Y immunity proteins were tested using site-directed mutagenesis nad construction oc colicin immunity hybrid molecules. Interactions sites in colicin immunity proteins were identified.

Links

GA310/03/1091, research and development project

Name: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Investor: Czech Science Foundation

Citovat

ŠMAJS, David and Petra MATĚJKOVÁ. Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins. In VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, p. 17. ISBN 80-210-3321-5.

@inproceedings{571695,
   author = {Šmajs, David and Matějková, Petra},
   address = {Brno},
   booktitle = {VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků.},
   keywords = {colicin; immunity protein},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {80-210-3321-5},
   pages = {17-17},
   publisher = {Masarykova univerzita v Brně},
   title = {Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins},
   year = {2004}
}

TY  - JOUR
ID  - 571695
AU  - Šmajs, David - Matějková, Petra
PY  - 2004
TI  - Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins
PB  - Masarykova univerzita v Brně
CY  - Brno
SN  - 8021033215
KW  - colicin
KW  - immunity protein
N2  - Pro identifikaci aminokyselinových zbytků imunitního proteinu kolicinu U a Y interagujících s kolicinem U a Y byly použity dvě základní techniky. První z nich spočívala v konstrukci hybridních proteinů mezi imunitními proteiny kolicinů U a Y a druhý přístup spočíval v cílené mutagenezi genu pro imunitní protein kolicinu U tak, aby změny v aminokyselinové sekvenci odpovídaly sekvenci imunitního proteinu kolicinu Y. Bylo připraveno 16 odlišných hybridních genů pro imunitní protein a 29 konstruktů zahrnujících záměnu 44 odlišných aminokyselinových zbytků (z celkového počtu 54 odlišných). U těchto konstruktů byla testována imunita ke kolicinům U, Y, A, B a N. Imunitní protein kolicinu U je zcela specifický pro kolicin U a nepřináší imunitu proti žádnému jinému testovanému kolicinu. Oproti tomu imunitní protein kolicinu Y přináší jak specifickou imunitu proti kolicinu Y (i když ne tak výraznou jako imunitní protein kolicinu U ke kolicinu U), tak částečnou imunitu ke kolicinu U a A (nikoliv však k sekvenčně příbuzným kolicinům B a N). Aminokyseliny významné pro imunitu ke kolicinu U jsou lokalizovány mezi zbytky 13 - 19 imunitního proteinu. Tyto aminokyseliny jsou lokalizovány v 1. transmembránovém úseku imunitního proteinu. Další interakční místo se předpokládá ve druhém a čtvrtém transmembránovém úseku. U imunitního proteinu kolicinu Y je pravděpodobné, že interakční místo s kolicinem Y tvoří aminokyselinové zbytky druhého a čtvrtého transmembránového úseku, které navzájem spolupracují a kódují imunitu ke kolicinu Y jen tehdy, jsou-li přítomny současně.
ER  -

ŠMAJS, David and Petra MATĚJKOVÁ. Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins. In \textit{VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků.}. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, p.~17. ISBN~80-210-3321-5.

Detailed Information on Publication Record