Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity
proteins

D 2004

Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins

ŠMAJS, David and Petra MATĚJKOVÁ

Basic information

Original name

Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins

Name in Czech

Interakce kolicinů U a Y s rekombinantními imunitními proteiny

Name (in English)

Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins

Authors

ŠMAJS, David (203 Czech Republic, guarantor) and Petra MATĚJKOVÁ (203 Czech Republic)

Edition

Brno, VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. p. 17-17, 2004

Publisher

Masarykova univerzita v Brně

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Proceedings paper

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

is not subject to a state or trade secret

RIV identification code

RIV/00216224:14110/04:00012098

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

80-210-3321-5

Keywords in English

colicin; immunity protein

Abstract

ORIG EN

V originále

Pro identifikaci aminokyselinových zbytků imunitního proteinu kolicinu U a Y interagujících s kolicinem U a Y byly použity dvě základní techniky. První z nich spočívala v konstrukci hybridních proteinů mezi imunitními proteiny kolicinů U a Y a druhý přístup spočíval v cílené mutagenezi genu pro imunitní protein kolicinu U tak, aby změny v aminokyselinové sekvenci odpovídaly sekvenci imunitního proteinu kolicinu Y. Bylo připraveno 16 odlišných hybridních genů pro imunitní protein a 29 konstruktů zahrnujících záměnu 44 odlišných aminokyselinových zbytků (z celkového počtu 54 odlišných). U těchto konstruktů byla testována imunita ke kolicinům U, Y, A, B a N. Imunitní protein kolicinu U je zcela specifický pro kolicin U a nepřináší imunitu proti žádnému jinému testovanému kolicinu. Oproti tomu imunitní protein kolicinu Y přináší jak specifickou imunitu proti kolicinu Y (i když ne tak výraznou jako imunitní protein kolicinu U ke kolicinu U), tak částečnou imunitu ke kolicinu U a A (nikoliv však k sekvenčně příbuzným kolicinům B a N). Aminokyseliny významné pro imunitu ke kolicinu U jsou lokalizovány mezi zbytky 13 - 19 imunitního proteinu. Tyto aminokyseliny jsou lokalizovány v 1. transmembránovém úseku imunitního proteinu. Další interakční místo se předpokládá ve druhém a čtvrtém transmembránovém úseku. U imunitního proteinu kolicinu Y je pravděpodobné, že interakční místo s kolicinem Y tvoří aminokyselinové zbytky druhého a čtvrtého transmembránového úseku, které navzájem spolupracují a kódují imunitu ke kolicinu Y jen tehdy, jsou-li přítomny současně.

In English

Interaction sotes in colicin U and Y immunity proteins were tested using site-directed mutagenesis nad construction oc colicin immunity hybrid molecules. Interactions sites in colicin immunity proteins were identified.

Links

GA310/03/1091, research and development project

Name: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Investor: Czech Science Foundation

Citovat

ŠMAJS, David and Petra MATĚJKOVÁ. Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins. In VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, p. 17. ISBN 80-210-3321-5.

@inproceedings{571695,
   author = {Šmajs, David and Matějková, Petra},
   address = {Brno},
   booktitle = {VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků.},
   keywords = {colicin; immunity protein},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {80-210-3321-5},
   pages = {17-17},
   publisher = {Masarykova univerzita v Brně},
   title = {Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins},
   year = {2004}
}

TY  - CONF
ID  - 571695
AU  - Šmajs, David - Matějková, Petra
PY  - 2004
TI  - Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins
PB  - Masarykova univerzita v Brně
CY  - Brno
SN  - 8021033215
KW  - colicin
KW  - immunity protein
N2  - Pro identifikaci aminokyselinových zbytků imunitního proteinu kolicinu U a Y interagujících s kolicinem U a Y byly použity dvě základní techniky. První z nich spočívala v konstrukci hybridních proteinů mezi imunitními proteiny kolicinů U a Y a druhý přístup spočíval v cílené mutagenezi genu pro imunitní protein kolicinu U tak, aby změny v aminokyselinové sekvenci odpovídaly sekvenci imunitního proteinu kolicinu Y. Bylo připraveno 16 odlišných hybridních genů pro imunitní protein a 29 konstruktů zahrnujících záměnu 44 odlišných aminokyselinových zbytků (z celkového počtu 54 odlišných). U těchto konstruktů byla testována imunita ke kolicinům U, Y, A, B a N. Imunitní protein kolicinu U je zcela specifický pro kolicin U a nepřináší imunitu proti žádnému jinému testovanému kolicinu. Oproti tomu imunitní protein kolicinu Y přináší jak specifickou imunitu proti kolicinu Y (i když ne tak výraznou jako imunitní protein kolicinu U ke kolicinu U), tak částečnou imunitu ke kolicinu U a A (nikoliv však k sekvenčně příbuzným kolicinům B a N). Aminokyseliny významné pro imunitu ke kolicinu U jsou lokalizovány mezi zbytky 13 - 19 imunitního proteinu. Tyto aminokyseliny jsou lokalizovány v 1. transmembránovém úseku imunitního proteinu. Další interakční místo se předpokládá ve druhém a čtvrtém transmembránovém úseku. U imunitního proteinu kolicinu Y je pravděpodobné, že interakční místo s kolicinem Y tvoří aminokyselinové zbytky druhého a čtvrtého transmembránového úseku, které navzájem spolupracují a kódují imunitu ke kolicinu Y jen tehdy, jsou-li přítomny současně.
ER  -

ŠMAJS, David and Petra MATĚJKOVÁ. Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins. In \textit{VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků.}. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, p.~17. ISBN~80-210-3321-5.

Detailed Information on Publication Record