2004
Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny
JANALÍKOVÁ, Magda a David ŠMAJSZákladní údaje
Originální název
Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny
Název česky
Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny
Název anglicky
Hybrid colicin U/Y Molecules and their interactyion with immunity proteins
Autoři
JANALÍKOVÁ, Magda (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant)
Vydání
2004. vyd. Brno, Sborník abstraktů XIII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2004, s. 14-14, 2004
Nakladatel
Lékařská fakulta MU
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14110/04:00012101
Organizační jednotka
Lékařská fakulta
Klíčová slova anglicky
colicin; immuinity proteins
Štítky
Změněno: 30. 5. 2005 14:38, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
V originále
Bylo zkonstruováno 16 hybridních proteinů kolicinů U/Y. Byly nalezeny 3 aminokyselinové zbytky hrající klíčovou roli v interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem a 4 aminokyselinové zbytky důležité pro tutéž interakci u kolicinu Y. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem jsou klíčové aminokyselinové zbytky F576, G580 a L594. Další interakční místo se nachází v pozici 590-592 (L590, A591, V592). Oproti tomu pro interakci kolicinu Y s jeho imunitním proteinem jsou významné jiné aminokyselinové zbytky, a to Y586, V590, A594 a A595. Menší význam v této interakci má i některá z 34 aminokyselin C-konce kolicinu Y (z nichž 12 je rozdílných oproti kolicinu U). Aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y interagující s příslušnými imunitními proteiny jsou lokalizovány do hydrofobní sekvence mezi helixy 8 a 9 kolicinové domény vytvářející kanál v plazmatické membráně.
Anglicky
Sixteen hybrid U/Y proteins were constructed. Three amino acid residues of colicin U and four amino acid residues of colicin Y were found to be important for interaction with cognate immunity proteins. The amino acid residues F576, G580 and L594 were found to be involved in the interaction between colicin U and its immunity protein. Another interaction region is located in the position 590-592. The amino acid residues Y586, V590, A594 and A595 were identified in recognition of colicin Y by its cognate immunity protein. In addition, one of the 34 amino acids in colicin Y C-terminal region (12 amino acids are different when compared to sequence of colicin U) had a slight effect in the recognition of colicin Y with its immunity protein. Important amino acid residues of colicin U and Y interacting with cognate immunity proteins were found to be located in the hydrophobic sequence between helices 8 and 9 in the colicin pore-forming domain.
Návaznosti
| GA310/03/1091, projekt VaV |
|