Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním
proteinem

D 2003

Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem

JANALÍKOVÁ, Magda and David ŠMAJS

Basic information

Original name

Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem

Name in Czech

Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem

Name (in English)

Hybrid colicin U/Y molecules and interaction with immunity proteins

Authors

JANALÍKOVÁ, Magda (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

2003. vyd. Brno, Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003, p. 15-15, 2003

Publisher

Lékařská fakulta MU

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14110/03:00012111

Organization unit

Faculty of Medicine

Keywords in English

colicin; immunity protein

Abstract

ORIG EN

V originále

V nedávné době byly popsány a molekulárně charakterizovány dva nové koliciny U a Y. Plazmid pColU, který byl identifikován v bakterii Shigella boydii, nese skupinu genů zahrnující gen pro kolicin U, gen pro imunitní protein a gen pro lytický protein. Plazmid pCol-Let, který byl izolován z bakterie E. coli, nese podobnou skupinu genů pro kolicin Y a geny pro imunitní a lytické proteiny. Příbuznost těchto kolicinů je založena na sekvenční podobnosti kolicinů, imunitních proteinů a proteinů lytických. Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y, nejsou producenti obou kolicinů zkříženě imunní. Jednou z možností studia interakce kolicinu s imunitním proteinem je zkoumání letálního účinku hybridních či mutovaných kolicinů (jejichž producenti nejsou zkříženě imunní) na buňky transformované plazmidem nesoucím imunitní protein. Zkonstruovali jsme pět hybridních proteinů kolicinu U/Y a zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu U kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa (34 aminokyselin od C-konce z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách. Navíc jsou připravovány hybridní molekuly imunitních proteinů U/Y, které budou použity pro studium oblastí imunitních proteinů interagujících s koliciny U a Y.

In English

Interaction of colicins with their cognate immunity proteins has been studied. Amino acid residues important for recognition of colicin molecule were found for colicin Y and for colicin U.

Links

GA310/03/1091, research and development project

Name: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Investor: Czech Science Foundation

Citovat

JANALÍKOVÁ, Magda and David ŠMAJS. Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem (Hybrid colicin U/Y molecules and interaction with immunity proteins). In Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003. 2003rd ed. Brno: Lékařská fakulta MU, 2003, p. 15.

@inproceedings{571752,
   author = {Janalíková, Magda and Šmajs, David},
   address = {Brno},
   booktitle = {Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003},
   edition = {2003},
   keywords = {colicin; immunity protein},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   pages = {15-15},
   publisher = {Lékařská fakulta MU},
   title = {Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem},
   year = {2003}
}

TY  - JOUR
ID  - 571752
AU  - Janalíková, Magda - Šmajs, David
PY  - 2003
TI  - Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem
PB  - Lékařská fakulta MU
CY  - Brno
KW  - colicin
KW  - immunity protein
N2  - V nedávné době byly popsány a molekulárně charakterizovány dva nové koliciny U a Y. Plazmid pColU, který byl identifikován v bakterii Shigella boydii, nese skupinu genů zahrnující gen pro kolicin U, gen pro imunitní protein a gen pro lytický protein. Plazmid pCol-Let, který byl izolován z bakterie E. coli, nese podobnou skupinu genů pro kolicin Y a geny pro imunitní a lytické proteiny. Příbuznost těchto kolicinů je založena na sekvenční podobnosti kolicinů, imunitních proteinů a proteinů lytických. Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y, nejsou producenti obou kolicinů zkříženě imunní. Jednou z možností studia interakce kolicinu s imunitním proteinem je zkoumání letálního účinku hybridních či mutovaných kolicinů (jejichž producenti nejsou zkříženě imunní) na buňky transformované plazmidem nesoucím imunitní protein. Zkonstruovali jsme pět hybridních proteinů kolicinu U/Y a zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu U kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa (34 aminokyselin od C-konce z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách. Navíc jsou připravovány hybridní molekuly imunitních proteinů U/Y, které budou použity pro studium oblastí imunitních proteinů interagujících s koliciny U a Y.
ER  -

JANALÍKOVÁ, Magda and David ŠMAJS. Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem (Hybrid colicin U/Y molecules and interaction with immunity proteins). In \textit{Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003}. 2003rd ed. Brno: Lékařská fakulta MU, 2003, p.~15.

Detailed Information on Publication Record