ŠVEC, Pavel, Marc VANCANNEYT, Milan SEMAN, Cindy SNAUWAERT, Karen LEFEBVRE, Ivo SEDLÁČEK a Jean SWINGS. Evaluation of (GTG)5-PCR for identification of Enterococcus spp. FEMS Microbiology Letters. Amsterdam, Netherlands: Elsevier Science B. V., 2005, roč. 247, č. 1, s. 59-63. ISSN 0378-1097.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Evaluation of (GTG)5-PCR for identification of Enterococcus spp.
Název česky Využití (GTG)5-PCR pro identifikaci Enterococcus spp.
Autoři ŠVEC, Pavel (203 Česká republika, garant), Marc VANCANNEYT (56 Belgie), Milan SEMAN (703 Slovensko), Cindy SNAUWAERT (56 Belgie), Karen LEFEBVRE (56 Belgie), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika) a Jean SWINGS (56 Belgie).
Vydání FEMS Microbiology Letters, Amsterdam, Netherlands, Elsevier Science B. V. 2005, 0378-1097.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Nizozemské království
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 2.057
Kód RIV RIV/00216224:14310/05:00013780
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000229707200008
Klíčová slova anglicky Enterococcus; rep-PCR; (GTG)5-PCR; identification; bryndza; water
Štítky (GTG)5-PCR, bryndza, Enterococcus, identification, rep-PCR, water
Změnil Změnil: doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D., učo 1098. Změněno: 18. 6. 2009 12:14.
Anotace
A set of reference strains and a group of previously unidentified enterococci were analysed by rep-PCR with the (GTG)5 primer to evaluate the discriminatory power and suitability of this method for typing and identification of enterococcal species. A total of 49 strains representing all validly described species were obtained from bacterial collections. For more extensive evaluation of this identification approach 112 well-defined and identified enterococci isolated from bryndza cheese were tested. The (GTG)5-PCR fingerprinting assigned all strains into well-differentiated clusters representing individual species. Subsequently, a group including 44 unidentified enterococci isolated from surface waters was analysed to evaluate this method for identification of unknown isolates. Obtained band patterns allowed us to identify all the strains clearly to the species level. This study proved that rep-PCR with (GTG)5 primer is a reliable and fast method for species identification of enterococci.
Anotace česky
Skupina referenčních a neidentifikovaných kmenů enterokoků byla analyzována rep-PCR s (GTG)5 primerem pro zjištění rozlišovaní schopnosti a vhodnosti této metody pro typizaci a identifikaci druhů enterokoků. Celkem 49 kmenů reprezentujících všechny doposud popsané druhy enterokoků bylo získáno z bakteriálních sbírek. Pro spolehlivější ověření tohoto identifikačního přístupu bylo dále testováno 112 dobře charakterizovaných enterokoků izolovaných z bryndzy. Výsledky (GTG)5-PCR zařadily všechny kmeny do jasně oddělených skupin reprezentujících jednotlivé druhy. Následně byla metoda použita pro identifikaci 44 blíže neurčených kmenů enterokoků izolovaných z povrchových vod. Získané výsledky jasně zařadily tyto kmeny do jednotlivých druhů. Tato studie prokázala, že rep-PCR s (GTG)5 primerem je vhodná a rychlá metoda pro druhovou identifikaci enterokoků.
Návaznosti
MSM0021622416, záměrNázev: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase
VytisknoutZobrazeno: 31. 7. 2024 08:30