2005
Evaluation of (GTG)5-PCR for identification of Enterococcus spp.
ŠVEC, Pavel, Marc VANCANNEYT, Milan SEMAN, Cindy SNAUWAERT, Karen LEFEBVRE et. al.Základní údaje
Originální název
Evaluation of (GTG)5-PCR for identification of Enterococcus spp.
Název česky
Využití (GTG)5-PCR pro identifikaci Enterococcus spp.
Autoři
ŠVEC, Pavel (203 Česká republika, garant), Marc VANCANNEYT (56 Belgie), Milan SEMAN (703 Slovensko), Cindy SNAUWAERT (56 Belgie), Karen LEFEBVRE (56 Belgie), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika) a Jean SWINGS (56 Belgie)
Vydání
FEMS Microbiology Letters, Amsterdam, Netherlands, Elsevier Science B. V. 2005, 0378-1097
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Nizozemské království
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 2.057
Kód RIV
RIV/00216224:14310/05:00013780
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000229707200008
Klíčová slova anglicky
Enterococcus; rep-PCR; (GTG)5-PCR; identification; bryndza; water
Štítky
Změněno: 18. 6. 2009 12:14, doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D.
V originále
A set of reference strains and a group of previously unidentified enterococci were analysed by rep-PCR with the (GTG)5 primer to evaluate the discriminatory power and suitability of this method for typing and identification of enterococcal species. A total of 49 strains representing all validly described species were obtained from bacterial collections. For more extensive evaluation of this identification approach 112 well-defined and identified enterococci isolated from bryndza cheese were tested. The (GTG)5-PCR fingerprinting assigned all strains into well-differentiated clusters representing individual species. Subsequently, a group including 44 unidentified enterococci isolated from surface waters was analysed to evaluate this method for identification of unknown isolates. Obtained band patterns allowed us to identify all the strains clearly to the species level. This study proved that rep-PCR with (GTG)5 primer is a reliable and fast method for species identification of enterococci.
Česky
Skupina referenčních a neidentifikovaných kmenů enterokoků byla analyzována rep-PCR s (GTG)5 primerem pro zjištění rozlišovaní schopnosti a vhodnosti této metody pro typizaci a identifikaci druhů enterokoků. Celkem 49 kmenů reprezentujících všechny doposud popsané druhy enterokoků bylo získáno z bakteriálních sbírek. Pro spolehlivější ověření tohoto identifikačního přístupu bylo dále testováno 112 dobře charakterizovaných enterokoků izolovaných z bryndzy. Výsledky (GTG)5-PCR zařadily všechny kmeny do jasně oddělených skupin reprezentujících jednotlivé druhy. Následně byla metoda použita pro identifikaci 44 blíže neurčených kmenů enterokoků izolovaných z povrchových vod. Získané výsledky jasně zařadily tyto kmeny do jednotlivých druhů. Tato studie prokázala, že rep-PCR s (GTG)5 primerem je vhodná a rychlá metoda pro druhovou identifikaci enterokoků.
Návaznosti
| MSM0021622416, záměr |
|