BOUCHAL, Pavel, Zbyněk ZDRÁHAL, Oldřich JANICZEK, Šárka HELÁNOVÁ, Kevin B. HALLBERG a Martin MANDL. Proteomic analysis of iron and sulfur oxidizing Acidithiobacillus ferrooxidans using immobilized pH gradients and mass spectrometry. In Molecular & Cellular Proteomics 4, 8 (Suppl. 1). 2005. ISSN 1535-9476.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Proteomic analysis of iron and sulfur oxidizing Acidithiobacillus ferrooxidans using immobilized pH gradients and mass spectrometry
Název česky Proteomová analýza bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans rostlé na síře a na železe pomocí imobilizovaných pH gradientů a hmotnostní spektrometrie
Autoři BOUCHAL, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí), Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, domácí), Oldřich JANICZEK (203 Česká republika, domácí), Šárka HELÁNOVÁ (203 Česká republika, domácí), Kevin B. HALLBERG (826 Velká Británie a Severní Irsko) a Martin MANDL (203 Česká republika, domácí).
Vydání Molecular & Cellular Proteomics 4, 8 (Suppl. 1), 2005.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 9.876
Kód RIV RIV/00216224:14310/05:00012638
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISSN 1535-9476
Klíčová slova anglicky Acidithiobacillus ferrooxidans; proteome analysis
Štítky Acidithiobacillus ferrooxidans, Proteome analysis
Příznaky Mezinárodní význam
Změnil Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 25. 8. 2016 09:17.
Anotace
Acidithiobacillus ferrooxidans is a chemolithotrophic microorganism oxidizing ferrous iron and inorganic reduced sulfur substances. These bacteria are involved in formation of acid mine drainage and in biohydrometallurgic technologies. Both iron- and sulfur-oxidizing cells play a different role in oxidation of metal sulfides. Specific proteins can be expected for each type of iron or sulfur metabolism. For the above reasons, comparative analysis of protein composition of Acidithiobacillus ferrooxidans cells grown on elemental sulfur and ferrous iron was performed. Newly developed protocol involving two-dimensional gel electrophoresis with immobilized pH gradients, improved protein reduction, mass spectrometry protein identification and full genome information was applied. It resulted in more than 1300 protein spots displayed in broad and basic pH ranges, the best A. ferrooxidans proteome resolution to date. A comparative image analysis revealed that the proteome was significantly influenced by the growth type. Many physiologically important proteins were detected using peptide mass fingerprinting and LC-MS/MS. The most interestingly, sulfate adenylytransferase involved in sulfate assimilation and sulfide dehydrogenase are between them. Many other proteins were related to important metabolic processes like substrate sorption, electron transport and inorganic ion transport. Detailed view of phosphate and sulfate transporters indicated possible interaction and/or cooperation of these proteins, as well as their post-translational modifications.
Anotace česky
Pro proteomovou analýzu bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans byla optimalizována nová metoda za použití 2-D elektroforézy s imobilizovanými pH gradienty, hmotnostní spektrometrie a kompletní genomové informace. Byla detegována řada fyziologicky významných proteinů zapojených do transportu a metabolismu síry a železa.
Návaznosti
GA525/04/1309, projekt VaVNázev: Bakteriální oxidace anorganických sirných látek, ekologické aspekty
Investor: Grantová agentura ČR, Bakteriální oxidace anorganických sirných látek, ekologické aspekty
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
VytisknoutZobrazeno: 13. 5. 2024 17:20