D 2005

A Method for Detecting Breakpoints in Array CGH data

BUDINSKÁ, Eva a Eva GELNAROVÁ

Základní údaje

Originální název

A Method for Detecting Breakpoints in Array CGH data

Název česky

Metoda detekce bodů zlomu u array CGH dat

Vydání

Brno, EnviroInfo Brno 2005. Networking Environmental Information. Part 2. Proceedings of the 19th International Conference Informatics for Environmental Protection. od s. 673 - 676, 4 s. 2005

Nakladatel

Masaryk University in Brno

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10103 Statistics and probability

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

80-210-3780-6

Klíčová slova anglicky

array CGH; breakpoint detection; analysis; microarray
Změněno: 28. 4. 2006 19:26, RNDr. Eva Gelnarová

Anotace

V originále

In present, microarray CGH experiments became a powerful technique for analysing changes in DNA, by comparing control DNA and DNA of interest. This is widely used for example in genome cancer or species distin-guishing studies. The method produce huge amount of data and special statistic techniques for detecting copy number changes regions are necessary. We propose a new method for detecting breakpoints in DNA. The performance of the method is demonstrated using publicly available data set.

Česky

V současné době se microarray CGH experimenty stávají stále více využívanou technologií pro analýzu změn v DNA, a to porovnáváním kontrolní a studované DNA. Výsledkem metody je značné množství dat, kterých analýza (detekce změnených regionů) vyžaduje speciální statistické techniky. V tomto příspěvku navrhujeme novou metodu pro detekci bodů zlomu v DNA. Výsledky metody demonstrujeme na veřejně přístupném datasetu.

Návaznosti

1ET208120511, projekt VaV
Název: Implementace a validace robustního znalostního analytického systému UIRON pro oblast onkologie
Investor: Akademie věd ČR, Implementace a validace robustního analytického systému UIRON pro oblast onkologie