HAVLIŠ, Jan, Ondrej ŠEDO a Zbyněk ZDRÁHAL. Indirect quantification of protein modification degree. In Book of abstracts 2nd Czech Proteomic Conference. 2005.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Indirect quantification of protein modification degree
Název česky Nepřímé stanovení rozsahu modifikace proteinu
Autoři HAVLIŠ, Jan (203 Česká republika, garant), Ondrej ŠEDO (203 Česká republika) a Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika).
Vydání Book of abstracts 2nd Czech Proteomic Conference, 2005.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/05:00014091
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky protein modification degree; post-translation modification; mass spectrometry
Štítky mass spectrometry, post-translation modification, protein modification degree
Změnil Změnil: doc. Mgr. Jan Havliš, Dr., učo 743. Změněno: 9. 4. 2010 14:57.
Anotace
In our work, we present a general, indirect method, using which it is possible to quantify the percentage of the given amino acid modified in total in a protein sequence (protein modification degree, PMD). From the knowledge of the identity of amino acid residues modifiable during post-translation process, PMD and its changes during time of particular amino acid residue can be determined. Such a quantification can be achieved by means of easy stable isotope modification (via 18O-labelling by trypsination) and consequential MALDI TOF MS analysis.
Anotace česky
Tato práce prezentuje obecnou, nepřímou metodu, pomocí níž je možné stanovit rozsah celkové modifikace dané aminokyseliny proteinu (protein modification degree, PMD). Známe-li identitu aminokyseliny modifikovatelné posttranslační modifikací, PMD a její změny ve vztahu k těmto aminokyselin mohou být takto stanoveny. Toto stanovení je dosaženo snadným značením stabilními izotopy (značení 18O v průběhu stěpení trypsinem) a následnou MALDI TOF MS analýzou.
Návaznosti
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
VytisknoutZobrazeno: 29. 7. 2024 02:26